Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNU13P55769 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNU13P55769 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNU13P55769 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNU13P55769 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNU13P55769 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNU13P55769 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNU13P55769 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNU13P55769 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNU13P55769 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNU13P55769 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNU13P55769 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNU13P55769 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNU13P55769 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNU13P55769 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNU13P55769 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNU13P55769 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNU13P55769 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNU13P55769 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNU13P55769 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNU13P55769 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNU13P55769 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNU13P55769 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNU13P55769 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNU13P55769 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNU13P55769 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNU13P55769 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNU13P55769 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNU13P55769 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNU13P55769 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNU13P55769 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNU13P55769 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNU13P55769 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNU13P55769 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNU13P55769 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNU13P55769 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNU13P55769 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNU13P55769 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNU13P55769 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNU13P55769 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNU13P55769 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNU13P55769 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNU13P55769 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNU13P55769 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNU13P55769 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNU13P55769 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNU13P55769 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNU13P55769 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNU13P55769 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNU13P55769 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNU13P55769 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNU13P55769 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNU13P55769 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNU13P55769 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNU13P55769 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNU13P55769 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNU13P55769 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNU13P55769 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNU13P55769 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNU13P55769 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNU13P55769 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNU13P55769 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNU13P55769 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNU13P55769 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNU13P55769 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNU13P55769 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNU13P55769 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNU13P55769 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNU13P55769 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNU13P55769 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNU13P55769 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNU13P55769 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNU13P55769 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNU13P55769 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNU13P55769 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNU13P55769 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNU13P55769 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNU13P55769 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNU13P55769 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNU13P55769 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNU13P55769 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNU13P55769 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNU13P55769 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNU13P55769 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNU13P55769 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNU13P55769 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNU13P55769 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNU13P55769 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNU13P55769 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNU13P55769 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNU13P55769 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNU13P55769 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNU13P55769 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNU13P55769 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNU13P55769 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNU13P55769 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNU13P55769 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNU13P55769 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNU13P55769 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNU13P55769 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms