Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC12A2P55011 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC12A2P55011 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC12A2P55011 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC12A2P55011 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC12A2P55011 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC12A2P55011 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC12A2P55011 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC12A2P55011 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC12A2P55011 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC12A2P55011 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC12A2P55011 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC12A2P55011 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC12A2P55011 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC12A2P55011 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC12A2P55011 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC12A2P55011 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC12A2P55011 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC12A2P55011 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC12A2P55011 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC12A2P55011 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC12A2P55011 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC12A2P55011 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC12A2P55011 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC12A2P55011 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC12A2P55011 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC12A2P55011 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC12A2P55011 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC12A2P55011 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC12A2P55011 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC12A2P55011 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC12A2P55011 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC12A2P55011 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC12A2P55011 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC12A2P55011 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC12A2P55011 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC12A2P55011 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC12A2P55011 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC12A2P55011 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC12A2P55011 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC12A2P55011 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC12A2P55011 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC12A2P55011 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC12A2P55011 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC12A2P55011 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC12A2P55011 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC12A2P55011 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC12A2P55011 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC12A2P55011 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC12A2P55011 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC12A2P55011 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC12A2P55011 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC12A2P55011 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC12A2P55011 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC12A2P55011 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC12A2P55011 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC12A2P55011 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC12A2P55011 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC12A2P55011 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC12A2P55011 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC12A2P55011 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC12A2P55011 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC12A2P55011 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC12A2P55011 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC12A2P55011 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC12A2P55011 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC12A2P55011 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC12A2P55011 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC12A2P55011 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC12A2P55011 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC12A2P55011 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC12A2P55011 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC12A2P55011 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC12A2P55011 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC12A2P55011 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC12A2P55011 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC12A2P55011 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC12A2P55011 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC12A2P55011 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC12A2P55011 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC12A2P55011 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC12A2P55011 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC12A2P55011 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC12A2P55011 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC12A2P55011 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC12A2P55011 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC12A2P55011 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC12A2P55011 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC12A2P55011 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC12A2P55011 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC12A2P55011 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC12A2P55011 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC12A2P55011 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC12A2P55011 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC12A2P55011 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC12A2P55011 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC12A2P55011 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC12A2P55011 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC12A2P55011 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC12A2P55011 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms