Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PGGT1BP53609 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGGT1BP53609 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGGT1BP53609 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGGT1BP53609 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGGT1BP53609 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGGT1BP53609 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGGT1BP53609 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGGT1BP53609 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGGT1BP53609 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGGT1BP53609 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGGT1BP53609 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGGT1BP53609 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PGGT1BP53609 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PGGT1BP53609 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PGGT1BP53609 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PGGT1BP53609 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGGT1BP53609 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGGT1BP53609 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PGGT1BP53609 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PGGT1BP53609 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PGGT1BP53609 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PGGT1BP53609 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PGGT1BP53609 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PGGT1BP53609 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PGGT1BP53609 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PGGT1BP53609 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PGGT1BP53609 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PGGT1BP53609 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PGGT1BP53609 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PGGT1BP53609 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGGT1BP53609 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGGT1BP53609 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGGT1BP53609 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGGT1BP53609 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PGGT1BP53609 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PGGT1BP53609 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PGGT1BP53609 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PGGT1BP53609 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PGGT1BP53609 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PGGT1BP53609 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PGGT1BP53609 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PGGT1BP53609 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PGGT1BP53609 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PGGT1BP53609 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PGGT1BP53609 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PGGT1BP53609 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PGGT1BP53609 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PGGT1BP53609 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PGGT1BP53609 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PGGT1BP53609 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGGT1BP53609 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGGT1BP53609 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PGGT1BP53609 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PGGT1BP53609 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PGGT1BP53609 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PGGT1BP53609 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PGGT1BP53609 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGGT1BP53609 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PGGT1BP53609 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PGGT1BP53609 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PGGT1BP53609 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PGGT1BP53609 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PGGT1BP53609 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PGGT1BP53609 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PGGT1BP53609 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PGGT1BP53609 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PGGT1BP53609 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PGGT1BP53609 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGGT1BP53609 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PGGT1BP53609 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PGGT1BP53609 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PGGT1BP53609 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGGT1BP53609 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGGT1BP53609 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PGGT1BP53609 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGGT1BP53609 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PGGT1BP53609 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PGGT1BP53609 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PGGT1BP53609 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PGGT1BP53609 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PGGT1BP53609 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PGGT1BP53609 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PGGT1BP53609 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGGT1BP53609 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGGT1BP53609 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGGT1BP53609 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PGGT1BP53609 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGGT1BP53609 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PGGT1BP53609 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGGT1BP53609 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGGT1BP53609 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGGT1BP53609 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PGGT1BP53609 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PGGT1BP53609 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PGGT1BP53609 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PGGT1BP53609 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PGGT1BP53609 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PGGT1BP53609 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PGGT1BP53609 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
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