Protein–RNA interactions for Protein: P52926

HMGA2, High mobility group protein HMGI-C, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA2P52926 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGA2P52926 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGA2P52926 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HMGA2P52926 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGA2P52926 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGA2P52926 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGA2P52926 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGA2P52926 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGA2P52926 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGA2P52926 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGA2P52926 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGA2P52926 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGA2P52926 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGA2P52926 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGA2P52926 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGA2P52926 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGA2P52926 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
HMGA2P52926 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGA2P52926 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGA2P52926 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGA2P52926 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGA2P52926 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGA2P52926 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGA2P52926 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGA2P52926 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGA2P52926 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGA2P52926 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGA2P52926 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGA2P52926 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGA2P52926 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGA2P52926 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGA2P52926 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGA2P52926 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGA2P52926 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGA2P52926 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGA2P52926 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGA2P52926 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGA2P52926 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGA2P52926 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGA2P52926 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGA2P52926 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGA2P52926 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGA2P52926 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGA2P52926 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGA2P52926 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGA2P52926 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGA2P52926 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGA2P52926 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGA2P52926 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGA2P52926 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGA2P52926 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGA2P52926 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGA2P52926 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGA2P52926 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGA2P52926 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGA2P52926 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGA2P52926 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGA2P52926 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGA2P52926 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGA2P52926 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGA2P52926 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGA2P52926 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGA2P52926 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGA2P52926 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGA2P52926 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGA2P52926 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGA2P52926 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGA2P52926 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGA2P52926 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGA2P52926 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGA2P52926 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGA2P52926 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGA2P52926 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HMGA2P52926 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HMGA2P52926 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGA2P52926 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGA2P52926 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGA2P52926 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGA2P52926 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGA2P52926 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGA2P52926 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGA2P52926 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGA2P52926 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGA2P52926 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGA2P52926 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGA2P52926 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGA2P52926 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGA2P52926 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGA2P52926 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGA2P52926 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGA2P52926 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGA2P52926 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGA2P52926 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGA2P52926 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGA2P52926 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGA2P52926 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGA2P52926 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGA2P52926 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGA2P52926 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGA2P52926 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms