Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLCN5P51795 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLCN5P51795 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLCN5P51795 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CLCN5P51795 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLCN5P51795 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLCN5P51795 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLCN5P51795 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CLCN5P51795 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLCN5P51795 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLCN5P51795 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLCN5P51795 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLCN5P51795 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CLCN5P51795 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLCN5P51795 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLCN5P51795 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLCN5P51795 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLCN5P51795 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CLCN5P51795 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLCN5P51795 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLCN5P51795 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLCN5P51795 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLCN5P51795 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLCN5P51795 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLCN5P51795 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CLCN5P51795 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLCN5P51795 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLCN5P51795 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLCN5P51795 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLCN5P51795 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLCN5P51795 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLCN5P51795 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLCN5P51795 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLCN5P51795 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLCN5P51795 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLCN5P51795 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLCN5P51795 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLCN5P51795 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLCN5P51795 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CLCN5P51795 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CLCN5P51795 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLCN5P51795 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLCN5P51795 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLCN5P51795 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLCN5P51795 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLCN5P51795 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CLCN5P51795 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CLCN5P51795 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLCN5P51795 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLCN5P51795 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLCN5P51795 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLCN5P51795 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLCN5P51795 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLCN5P51795 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLCN5P51795 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLCN5P51795 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLCN5P51795 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLCN5P51795 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLCN5P51795 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CLCN5P51795 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLCN5P51795 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CLCN5P51795 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLCN5P51795 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLCN5P51795 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLCN5P51795 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLCN5P51795 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLCN5P51795 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLCN5P51795 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLCN5P51795 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLCN5P51795 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLCN5P51795 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLCN5P51795 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLCN5P51795 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLCN5P51795 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLCN5P51795 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLCN5P51795 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLCN5P51795 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLCN5P51795 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLCN5P51795 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLCN5P51795 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLCN5P51795 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLCN5P51795 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLCN5P51795 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CLCN5P51795 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CLCN5P51795 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLCN5P51795 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLCN5P51795 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLCN5P51795 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLCN5P51795 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLCN5P51795 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLCN5P51795 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLCN5P51795 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CLCN5P51795 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLCN5P51795 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLCN5P51795 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLCN5P51795 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLCN5P51795 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLCN5P51795 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLCN5P51795 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLCN5P51795 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms