Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
BRCA2P51587 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
BRCA2P51587 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
BRCA2P51587 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
BRCA2P51587 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
BRCA2P51587 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BRCA2P51587 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
BRCA2P51587 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
BRCA2P51587 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BRCA2P51587 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
BRCA2P51587 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
BRCA2P51587 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
BRCA2P51587 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
BRCA2P51587 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
BRCA2P51587 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BRCA2P51587 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRCA2P51587 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRCA2P51587 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRCA2P51587 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BRCA2P51587 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
BRCA2P51587 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BRCA2P51587 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRCA2P51587 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRCA2P51587 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
BRCA2P51587 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BRCA2P51587 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
BRCA2P51587 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
BRCA2P51587 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BRCA2P51587 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32■■■□□ 2.71
BRCA2P51587 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
BRCA2P51587 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
BRCA2P51587 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
BRCA2P51587 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
BRCA2P51587 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
BRCA2P51587 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
BRCA2P51587 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
BRCA2P51587 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
BRCA2P51587 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
BRCA2P51587 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
BRCA2P51587 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
BRCA2P51587 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
BRCA2P51587 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
BRCA2P51587 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
BRCA2P51587 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
BRCA2P51587 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
BRCA2P51587 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
BRCA2P51587 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
BRCA2P51587 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
BRCA2P51587 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
BRCA2P51587 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
BRCA2P51587 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
BRCA2P51587 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
BRCA2P51587 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
BRCA2P51587 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
BRCA2P51587 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
BRCA2P51587 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
BRCA2P51587 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
BRCA2P51587 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
BRCA2P51587 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
BRCA2P51587 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
BRCA2P51587 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
BRCA2P51587 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
BRCA2P51587 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
BRCA2P51587 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
BRCA2P51587 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
BRCA2P51587 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
BRCA2P51587 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
BRCA2P51587 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
BRCA2P51587 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
BRCA2P51587 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
BRCA2P51587 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
BRCA2P51587 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
BRCA2P51587 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
BRCA2P51587 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
BRCA2P51587 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
BRCA2P51587 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
BRCA2P51587 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
BRCA2P51587 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
BRCA2P51587 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
BRCA2P51587 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
BRCA2P51587 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
BRCA2P51587 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
BRCA2P51587 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
BRCA2P51587 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
BRCA2P51587 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
BRCA2P51587 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
BRCA2P51587 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
BRCA2P51587 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
BRCA2P51587 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
BRCA2P51587 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
BRCA2P51587 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
BRCA2P51587 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
BRCA2P51587 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
BRCA2P51587 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
BRCA2P51587 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
BRCA2P51587 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
BRCA2P51587 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
BRCA2P51587 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
BRCA2P51587 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
BRCA2P51587 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms