Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRIM2P49643 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRIM2P49643 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRIM2P49643 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRIM2P49643 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRIM2P49643 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRIM2P49643 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRIM2P49643 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRIM2P49643 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRIM2P49643 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRIM2P49643 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRIM2P49643 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRIM2P49643 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRIM2P49643 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRIM2P49643 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRIM2P49643 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRIM2P49643 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRIM2P49643 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRIM2P49643 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRIM2P49643 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRIM2P49643 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRIM2P49643 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRIM2P49643 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRIM2P49643 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRIM2P49643 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRIM2P49643 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRIM2P49643 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRIM2P49643 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM2P49643 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM2P49643 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRIM2P49643 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PRIM2P49643 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRIM2P49643 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRIM2P49643 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRIM2P49643 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRIM2P49643 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRIM2P49643 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRIM2P49643 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM2P49643 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM2P49643 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM2P49643 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM2P49643 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRIM2P49643 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRIM2P49643 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRIM2P49643 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRIM2P49643 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRIM2P49643 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRIM2P49643 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRIM2P49643 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRIM2P49643 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRIM2P49643 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRIM2P49643 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM2P49643 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM2P49643 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM2P49643 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM2P49643 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRIM2P49643 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRIM2P49643 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRIM2P49643 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRIM2P49643 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRIM2P49643 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRIM2P49643 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRIM2P49643 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM2P49643 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRIM2P49643 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRIM2P49643 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRIM2P49643 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM2P49643 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM2P49643 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRIM2P49643 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM2P49643 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM2P49643 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM2P49643 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM2P49643 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM2P49643 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM2P49643 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM2P49643 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM2P49643 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM2P49643 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM2P49643 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRIM2P49643 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRIM2P49643 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRIM2P49643 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRIM2P49643 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRIM2P49643 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRIM2P49643 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRIM2P49643 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRIM2P49643 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRIM2P49643 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRIM2P49643 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRIM2P49643 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM2P49643 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM2P49643 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM2P49643 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM2P49643 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM2P49643 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM2P49643 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIM2P49643 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIM2P49643 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIM2P49643 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms