Protein–RNA interactions for Protein: P49585

PCYT1A, Choline-phosphate cytidylyltransferase A, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1AP49585 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCYT1AP49585 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCYT1AP49585 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCYT1AP49585 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCYT1AP49585 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCYT1AP49585 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCYT1AP49585 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCYT1AP49585 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCYT1AP49585 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCYT1AP49585 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCYT1AP49585 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCYT1AP49585 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCYT1AP49585 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCYT1AP49585 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCYT1AP49585 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCYT1AP49585 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCYT1AP49585 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCYT1AP49585 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCYT1AP49585 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCYT1AP49585 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCYT1AP49585 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCYT1AP49585 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PCYT1AP49585 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCYT1AP49585 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCYT1AP49585 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCYT1AP49585 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCYT1AP49585 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCYT1AP49585 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCYT1AP49585 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCYT1AP49585 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCYT1AP49585 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PCYT1AP49585 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCYT1AP49585 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCYT1AP49585 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCYT1AP49585 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCYT1AP49585 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCYT1AP49585 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCYT1AP49585 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCYT1AP49585 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCYT1AP49585 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCYT1AP49585 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCYT1AP49585 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCYT1AP49585 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCYT1AP49585 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCYT1AP49585 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCYT1AP49585 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCYT1AP49585 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PCYT1AP49585 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCYT1AP49585 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCYT1AP49585 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCYT1AP49585 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCYT1AP49585 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCYT1AP49585 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCYT1AP49585 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCYT1AP49585 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCYT1AP49585 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCYT1AP49585 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCYT1AP49585 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCYT1AP49585 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCYT1AP49585 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCYT1AP49585 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCYT1AP49585 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCYT1AP49585 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCYT1AP49585 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCYT1AP49585 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCYT1AP49585 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCYT1AP49585 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCYT1AP49585 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCYT1AP49585 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCYT1AP49585 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCYT1AP49585 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCYT1AP49585 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCYT1AP49585 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCYT1AP49585 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCYT1AP49585 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCYT1AP49585 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCYT1AP49585 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCYT1AP49585 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCYT1AP49585 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCYT1AP49585 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCYT1AP49585 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCYT1AP49585 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCYT1AP49585 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCYT1AP49585 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCYT1AP49585 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCYT1AP49585 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCYT1AP49585 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCYT1AP49585 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCYT1AP49585 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCYT1AP49585 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCYT1AP49585 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCYT1AP49585 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCYT1AP49585 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCYT1AP49585 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCYT1AP49585 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCYT1AP49585 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCYT1AP49585 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCYT1AP49585 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCYT1AP49585 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCYT1AP49585 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms