Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CENPFP49454 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CENPFP49454 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CENPFP49454 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CENPFP49454 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CENPFP49454 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CENPFP49454 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CENPFP49454 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CENPFP49454 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CENPFP49454 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CENPFP49454 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CENPFP49454 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CENPFP49454 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CENPFP49454 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CENPFP49454 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
CENPFP49454 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CENPFP49454 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CENPFP49454 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CENPFP49454 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CENPFP49454 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CENPFP49454 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CENPFP49454 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CENPFP49454 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CENPFP49454 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CENPFP49454 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CENPFP49454 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CENPFP49454 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
CENPFP49454 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CENPFP49454 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CENPFP49454 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CENPFP49454 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CENPFP49454 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CENPFP49454 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CENPFP49454 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CENPFP49454 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CENPFP49454 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CENPFP49454 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CENPFP49454 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CENPFP49454 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CENPFP49454 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CENPFP49454 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CENPFP49454 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CENPFP49454 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CENPFP49454 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.73
CENPFP49454 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CENPFP49454 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CENPFP49454 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CENPFP49454 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CENPFP49454 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CENPFP49454 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CENPFP49454 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CENPFP49454 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CENPFP49454 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CENPFP49454 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CENPFP49454 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CENPFP49454 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CENPFP49454 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CENPFP49454 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CENPFP49454 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CENPFP49454 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CENPFP49454 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CENPFP49454 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CENPFP49454 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CENPFP49454 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CENPFP49454 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CENPFP49454 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CENPFP49454 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CENPFP49454 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CENPFP49454 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CENPFP49454 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CENPFP49454 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CENPFP49454 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CENPFP49454 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CENPFP49454 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CENPFP49454 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CENPFP49454 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CENPFP49454 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CENPFP49454 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
CENPFP49454 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CENPFP49454 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CENPFP49454 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CENPFP49454 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CENPFP49454 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CENPFP49454 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CENPFP49454 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CENPFP49454 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CENPFP49454 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CENPFP49454 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CENPFP49454 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CENPFP49454 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CENPFP49454 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CENPFP49454 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CENPFP49454 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CENPFP49454 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CENPFP49454 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CENPFP49454 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CENPFP49454 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CENPFP49454 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
CENPFP49454 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CENPFP49454 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
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