Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TGM4P49221 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TGM4P49221 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TGM4P49221 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TGM4P49221 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TGM4P49221 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TGM4P49221 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TGM4P49221 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TGM4P49221 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TGM4P49221 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TGM4P49221 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TGM4P49221 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TGM4P49221 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TGM4P49221 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TGM4P49221 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TGM4P49221 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TGM4P49221 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TGM4P49221 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGM4P49221 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGM4P49221 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGM4P49221 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGM4P49221 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGM4P49221 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TGM4P49221 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGM4P49221 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGM4P49221 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGM4P49221 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TGM4P49221 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TGM4P49221 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TGM4P49221 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TGM4P49221 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGM4P49221 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGM4P49221 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TGM4P49221 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TGM4P49221 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TGM4P49221 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TGM4P49221 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TGM4P49221 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TGM4P49221 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TGM4P49221 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TGM4P49221 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TGM4P49221 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TGM4P49221 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TGM4P49221 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TGM4P49221 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TGM4P49221 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TGM4P49221 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TGM4P49221 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TGM4P49221 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TGM4P49221 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TGM4P49221 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TGM4P49221 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TGM4P49221 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TGM4P49221 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TGM4P49221 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TGM4P49221 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TGM4P49221 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TGM4P49221 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TGM4P49221 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TGM4P49221 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TGM4P49221 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TGM4P49221 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TGM4P49221 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TGM4P49221 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TGM4P49221 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGM4P49221 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGM4P49221 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TGM4P49221 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGM4P49221 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGM4P49221 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGM4P49221 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGM4P49221 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM4P49221 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM4P49221 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM4P49221 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM4P49221 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGM4P49221 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TGM4P49221 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TGM4P49221 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGM4P49221 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM4P49221 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM4P49221 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM4P49221 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TGM4P49221 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGM4P49221 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGM4P49221 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGM4P49221 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGM4P49221 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGM4P49221 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGM4P49221 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGM4P49221 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGM4P49221 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGM4P49221 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGM4P49221 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGM4P49221 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGM4P49221 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGM4P49221 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGM4P49221 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGM4P49221 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGM4P49221 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms