Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PIP4K2AP48426 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PIP4K2AP48426 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PIP4K2AP48426 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PIP4K2AP48426 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PIP4K2AP48426 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PIP4K2AP48426 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PIP4K2AP48426 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PIP4K2AP48426 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PIP4K2AP48426 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PIP4K2AP48426 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PIP4K2AP48426 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PIP4K2AP48426 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
PIP4K2AP48426 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PIP4K2AP48426 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PIP4K2AP48426 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PIP4K2AP48426 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PIP4K2AP48426 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PIP4K2AP48426 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PIP4K2AP48426 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PIP4K2AP48426 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
PIP4K2AP48426 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PIP4K2AP48426 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PIP4K2AP48426 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PIP4K2AP48426 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PIP4K2AP48426 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PIP4K2AP48426 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PIP4K2AP48426 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PIP4K2AP48426 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
PIP4K2AP48426 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PIP4K2AP48426 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PIP4K2AP48426 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PIP4K2AP48426 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PIP4K2AP48426 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PIP4K2AP48426 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PIP4K2AP48426 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PIP4K2AP48426 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PIP4K2AP48426 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PIP4K2AP48426 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PIP4K2AP48426 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PIP4K2AP48426 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PIP4K2AP48426 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PIP4K2AP48426 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PIP4K2AP48426 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PIP4K2AP48426 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PIP4K2AP48426 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PIP4K2AP48426 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PIP4K2AP48426 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PIP4K2AP48426 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PIP4K2AP48426 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PIP4K2AP48426 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
PIP4K2AP48426 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PIP4K2AP48426 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PIP4K2AP48426 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PIP4K2AP48426 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
PIP4K2AP48426 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PIP4K2AP48426 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PIP4K2AP48426 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PIP4K2AP48426 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PIP4K2AP48426 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PIP4K2AP48426 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PIP4K2AP48426 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PIP4K2AP48426 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PIP4K2AP48426 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PIP4K2AP48426 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PIP4K2AP48426 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PIP4K2AP48426 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PIP4K2AP48426 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PIP4K2AP48426 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PIP4K2AP48426 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PIP4K2AP48426 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
PIP4K2AP48426 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PIP4K2AP48426 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PIP4K2AP48426 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PIP4K2AP48426 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PIP4K2AP48426 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
PIP4K2AP48426 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PIP4K2AP48426 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PIP4K2AP48426 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PIP4K2AP48426 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PIP4K2AP48426 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PIP4K2AP48426 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PIP4K2AP48426 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PIP4K2AP48426 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
PIP4K2AP48426 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PIP4K2AP48426 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PIP4K2AP48426 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PIP4K2AP48426 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PIP4K2AP48426 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PIP4K2AP48426 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PIP4K2AP48426 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PIP4K2AP48426 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PIP4K2AP48426 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PIP4K2AP48426 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PIP4K2AP48426 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PIP4K2AP48426 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PIP4K2AP48426 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PIP4K2AP48426 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
PIP4K2AP48426 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PIP4K2AP48426 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms