Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
UTRNP46939 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
UTRNP46939 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
UTRNP46939 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
UTRNP46939 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
UTRNP46939 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
UTRNP46939 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
UTRNP46939 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
UTRNP46939 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
UTRNP46939 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
UTRNP46939 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
UTRNP46939 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
UTRNP46939 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
UTRNP46939 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
UTRNP46939 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
UTRNP46939 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
UTRNP46939 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
UTRNP46939 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
UTRNP46939 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
UTRNP46939 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
UTRNP46939 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
UTRNP46939 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
UTRNP46939 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
UTRNP46939 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
UTRNP46939 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
UTRNP46939 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
UTRNP46939 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
UTRNP46939 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
UTRNP46939 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
UTRNP46939 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
UTRNP46939 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
UTRNP46939 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
UTRNP46939 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
UTRNP46939 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
UTRNP46939 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
UTRNP46939 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
UTRNP46939 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
UTRNP46939 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
UTRNP46939 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
UTRNP46939 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
UTRNP46939 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
UTRNP46939 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
UTRNP46939 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
UTRNP46939 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
UTRNP46939 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
UTRNP46939 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
UTRNP46939 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
UTRNP46939 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
UTRNP46939 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
UTRNP46939 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
UTRNP46939 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
UTRNP46939 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
UTRNP46939 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
UTRNP46939 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
UTRNP46939 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
UTRNP46939 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
UTRNP46939 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
UTRNP46939 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
UTRNP46939 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
UTRNP46939 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
UTRNP46939 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
UTRNP46939 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
UTRNP46939 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
UTRNP46939 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
UTRNP46939 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
UTRNP46939 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
UTRNP46939 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
UTRNP46939 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
UTRNP46939 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
UTRNP46939 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
UTRNP46939 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
UTRNP46939 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
UTRNP46939 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
UTRNP46939 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
UTRNP46939 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
UTRNP46939 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
UTRNP46939 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
UTRNP46939 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
UTRNP46939 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
UTRNP46939 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
UTRNP46939 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
UTRNP46939 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
UTRNP46939 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
UTRNP46939 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
UTRNP46939 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
UTRNP46939 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.18
UTRNP46939 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
UTRNP46939 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
UTRNP46939 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
UTRNP46939 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
UTRNP46939 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
UTRNP46939 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
UTRNP46939 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
UTRNP46939 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
UTRNP46939 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
UTRNP46939 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
UTRNP46939 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
UTRNP46939 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
UTRNP46939 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
UTRNP46939 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms