Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL28P46779 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL28P46779 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL28P46779 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL28P46779 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL28P46779 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL28P46779 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL28P46779 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL28P46779 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL28P46779 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL28P46779 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL28P46779 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL28P46779 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL28P46779 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL28P46779 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL28P46779 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL28P46779 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL28P46779 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL28P46779 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL28P46779 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL28P46779 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL28P46779 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL28P46779 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL28P46779 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL28P46779 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL28P46779 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL28P46779 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL28P46779 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL28P46779 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL28P46779 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL28P46779 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL28P46779 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL28P46779 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL28P46779 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL28P46779 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL28P46779 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL28P46779 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL28P46779 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL28P46779 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL28P46779 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL28P46779 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL28P46779 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL28P46779 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL28P46779 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL28P46779 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL28P46779 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL28P46779 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL28P46779 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL28P46779 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL28P46779 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL28P46779 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL28P46779 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL28P46779 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL28P46779 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL28P46779 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL28P46779 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL28P46779 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL28P46779 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL28P46779 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL28P46779 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL28P46779 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL28P46779 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL28P46779 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL28P46779 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL28P46779 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL28P46779 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL28P46779 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL28P46779 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL28P46779 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL28P46779 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL28P46779 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL28P46779 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL28P46779 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL28P46779 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL28P46779 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL28P46779 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL28P46779 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL28P46779 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL28P46779 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL28P46779 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL28P46779 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL28P46779 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL28P46779 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL28P46779 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL28P46779 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL28P46779 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL28P46779 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL28P46779 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL28P46779 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL28P46779 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL28P46779 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL28P46779 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL28P46779 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL28P46779 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL28P46779 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL28P46779 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL28P46779 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL28P46779 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL28P46779 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL28P46779 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms