Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC1A1P43005 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC1A1P43005 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC1A1P43005 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC1A1P43005 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC1A1P43005 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC1A1P43005 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC1A1P43005 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC1A1P43005 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC1A1P43005 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC1A1P43005 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC1A1P43005 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC1A1P43005 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC1A1P43005 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC1A1P43005 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC1A1P43005 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC1A1P43005 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC1A1P43005 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC1A1P43005 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC1A1P43005 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC1A1P43005 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC1A1P43005 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC1A1P43005 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC1A1P43005 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC1A1P43005 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC1A1P43005 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC1A1P43005 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC1A1P43005 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC1A1P43005 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC1A1P43005 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC1A1P43005 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC1A1P43005 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC1A1P43005 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC1A1P43005 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC1A1P43005 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC1A1P43005 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC1A1P43005 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC1A1P43005 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC1A1P43005 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC1A1P43005 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC1A1P43005 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC1A1P43005 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC1A1P43005 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC1A1P43005 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC1A1P43005 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC1A1P43005 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC1A1P43005 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC1A1P43005 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC1A1P43005 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC1A1P43005 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC1A1P43005 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC1A1P43005 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC1A1P43005 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC1A1P43005 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC1A1P43005 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC1A1P43005 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC1A1P43005 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC1A1P43005 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC1A1P43005 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC1A1P43005 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC1A1P43005 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC1A1P43005 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC1A1P43005 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC1A1P43005 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC1A1P43005 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC1A1P43005 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC1A1P43005 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC1A1P43005 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC1A1P43005 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC1A1P43005 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC1A1P43005 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC1A1P43005 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC1A1P43005 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC1A1P43005 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC1A1P43005 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC1A1P43005 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC1A1P43005 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC1A1P43005 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC1A1P43005 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC1A1P43005 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC1A1P43005 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC1A1P43005 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC1A1P43005 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC1A1P43005 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC1A1P43005 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC1A1P43005 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC1A1P43005 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC1A1P43005 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC1A1P43005 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC1A1P43005 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC1A1P43005 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC1A1P43005 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC1A1P43005 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC1A1P43005 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC1A1P43005 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC1A1P43005 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC1A1P43005 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC1A1P43005 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC1A1P43005 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SLC1A1P43005 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms