Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNFP41002 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNFP41002 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCNFP41002 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCNFP41002 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCNFP41002 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNFP41002 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNFP41002 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNFP41002 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNFP41002 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNFP41002 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNFP41002 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNFP41002 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNFP41002 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNFP41002 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNFP41002 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNFP41002 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNFP41002 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNFP41002 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNFP41002 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNFP41002 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNFP41002 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNFP41002 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNFP41002 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNFP41002 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCNFP41002 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNFP41002 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNFP41002 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNFP41002 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNFP41002 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNFP41002 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNFP41002 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNFP41002 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNFP41002 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNFP41002 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNFP41002 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNFP41002 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNFP41002 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNFP41002 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNFP41002 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNFP41002 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNFP41002 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNFP41002 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNFP41002 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNFP41002 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNFP41002 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNFP41002 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNFP41002 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNFP41002 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNFP41002 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNFP41002 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNFP41002 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNFP41002 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNFP41002 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNFP41002 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNFP41002 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNFP41002 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNFP41002 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNFP41002 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNFP41002 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNFP41002 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNFP41002 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNFP41002 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCNFP41002 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCNFP41002 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCNFP41002 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCNFP41002 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCNFP41002 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCNFP41002 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCNFP41002 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCNFP41002 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNFP41002 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNFP41002 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNFP41002 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNFP41002 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNFP41002 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNFP41002 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNFP41002 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNFP41002 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNFP41002 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNFP41002 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNFP41002 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNFP41002 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNFP41002 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNFP41002 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNFP41002 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNFP41002 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNFP41002 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNFP41002 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNFP41002 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCNFP41002 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNFP41002 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNFP41002 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNFP41002 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNFP41002 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNFP41002 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCNFP41002 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNFP41002 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNFP41002 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNFP41002 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms