Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGM1P36871 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGM1P36871 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGM1P36871 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGM1P36871 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PGM1P36871 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PGM1P36871 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGM1P36871 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGM1P36871 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGM1P36871 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGM1P36871 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGM1P36871 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGM1P36871 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGM1P36871 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PGM1P36871 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PGM1P36871 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PGM1P36871 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PGM1P36871 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGM1P36871 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGM1P36871 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGM1P36871 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGM1P36871 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGM1P36871 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGM1P36871 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PGM1P36871 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGM1P36871 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGM1P36871 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGM1P36871 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGM1P36871 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGM1P36871 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGM1P36871 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGM1P36871 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGM1P36871 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGM1P36871 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGM1P36871 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGM1P36871 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGM1P36871 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PGM1P36871 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGM1P36871 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PGM1P36871 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PGM1P36871 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PGM1P36871 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGM1P36871 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGM1P36871 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGM1P36871 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PGM1P36871 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PGM1P36871 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PGM1P36871 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGM1P36871 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PGM1P36871 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGM1P36871 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGM1P36871 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGM1P36871 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGM1P36871 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGM1P36871 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PGM1P36871 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PGM1P36871 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PGM1P36871 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGM1P36871 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGM1P36871 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PGM1P36871 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PGM1P36871 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGM1P36871 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGM1P36871 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGM1P36871 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PGM1P36871 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PGM1P36871 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGM1P36871 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGM1P36871 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGM1P36871 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PGM1P36871 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PGM1P36871 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PGM1P36871 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PGM1P36871 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PGM1P36871 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PGM1P36871 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PGM1P36871 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGM1P36871 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PGM1P36871 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PGM1P36871 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PGM1P36871 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGM1P36871 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PGM1P36871 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PGM1P36871 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PGM1P36871 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PGM1P36871 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGM1P36871 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PGM1P36871 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PGM1P36871 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGM1P36871 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PGM1P36871 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PGM1P36871 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGM1P36871 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGM1P36871 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PGM1P36871 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGM1P36871 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGM1P36871 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGM1P36871 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGM1P36871 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGM1P36871 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms