Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SOX5P35711 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SOX5P35711 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SOX5P35711 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SOX5P35711 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SOX5P35711 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SOX5P35711 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SOX5P35711 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SOX5P35711 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SOX5P35711 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SOX5P35711 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SOX5P35711 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SOX5P35711 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SOX5P35711 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SOX5P35711 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SOX5P35711 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SOX5P35711 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SOX5P35711 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SOX5P35711 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SOX5P35711 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SOX5P35711 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SOX5P35711 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SOX5P35711 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SOX5P35711 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SOX5P35711 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SOX5P35711 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SOX5P35711 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SOX5P35711 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SOX5P35711 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SOX5P35711 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SOX5P35711 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SOX5P35711 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SOX5P35711 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SOX5P35711 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SOX5P35711 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SOX5P35711 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SOX5P35711 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SOX5P35711 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SOX5P35711 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOX5P35711 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOX5P35711 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SOX5P35711 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SOX5P35711 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SOX5P35711 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SOX5P35711 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SOX5P35711 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SOX5P35711 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SOX5P35711 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SOX5P35711 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SOX5P35711 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SOX5P35711 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SOX5P35711 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SOX5P35711 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SOX5P35711 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOX5P35711 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SOX5P35711 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SOX5P35711 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SOX5P35711 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SOX5P35711 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SOX5P35711 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SOX5P35711 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SOX5P35711 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SOX5P35711 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SOX5P35711 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SOX5P35711 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SOX5P35711 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SOX5P35711 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SOX5P35711 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SOX5P35711 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SOX5P35711 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SOX5P35711 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SOX5P35711 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SOX5P35711 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SOX5P35711 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SOX5P35711 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SOX5P35711 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SOX5P35711 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SOX5P35711 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SOX5P35711 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SOX5P35711 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SOX5P35711 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SOX5P35711 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SOX5P35711 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SOX5P35711 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOX5P35711 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOX5P35711 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SOX5P35711 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SOX5P35711 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SOX5P35711 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SOX5P35711 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SOX5P35711 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SOX5P35711 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SOX5P35711 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SOX5P35711 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SOX5P35711 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SOX5P35711 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SOX5P35711 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SOX5P35711 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SOX5P35711 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SOX5P35711 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms