Protein–RNA interactions for Protein: P35442

THBS2, Thrombospondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS2P35442 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THBS2P35442 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
THBS2P35442 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THBS2P35442 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THBS2P35442 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THBS2P35442 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THBS2P35442 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THBS2P35442 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THBS2P35442 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THBS2P35442 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THBS2P35442 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THBS2P35442 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THBS2P35442 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THBS2P35442 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THBS2P35442 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THBS2P35442 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THBS2P35442 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THBS2P35442 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THBS2P35442 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THBS2P35442 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THBS2P35442 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THBS2P35442 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THBS2P35442 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THBS2P35442 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THBS2P35442 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THBS2P35442 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THBS2P35442 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THBS2P35442 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THBS2P35442 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THBS2P35442 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THBS2P35442 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THBS2P35442 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THBS2P35442 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THBS2P35442 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THBS2P35442 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THBS2P35442 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THBS2P35442 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THBS2P35442 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THBS2P35442 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THBS2P35442 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THBS2P35442 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THBS2P35442 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THBS2P35442 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THBS2P35442 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THBS2P35442 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THBS2P35442 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THBS2P35442 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
THBS2P35442 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THBS2P35442 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THBS2P35442 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THBS2P35442 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THBS2P35442 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THBS2P35442 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THBS2P35442 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THBS2P35442 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THBS2P35442 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THBS2P35442 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THBS2P35442 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THBS2P35442 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THBS2P35442 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THBS2P35442 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THBS2P35442 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THBS2P35442 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THBS2P35442 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THBS2P35442 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THBS2P35442 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THBS2P35442 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THBS2P35442 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THBS2P35442 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THBS2P35442 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THBS2P35442 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THBS2P35442 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THBS2P35442 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THBS2P35442 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THBS2P35442 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THBS2P35442 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THBS2P35442 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THBS2P35442 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
THBS2P35442 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THBS2P35442 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THBS2P35442 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THBS2P35442 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THBS2P35442 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THBS2P35442 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THBS2P35442 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THBS2P35442 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THBS2P35442 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THBS2P35442 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THBS2P35442 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THBS2P35442 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
THBS2P35442 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
THBS2P35442 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THBS2P35442 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
THBS2P35442 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THBS2P35442 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THBS2P35442 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THBS2P35442 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THBS2P35442 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THBS2P35442 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THBS2P35442 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms