Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NTF4P34130 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTF4P34130 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTF4P34130 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTF4P34130 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTF4P34130 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTF4P34130 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTF4P34130 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTF4P34130 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTF4P34130 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTF4P34130 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTF4P34130 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTF4P34130 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTF4P34130 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NTF4P34130 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NTF4P34130 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NTF4P34130 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NTF4P34130 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTF4P34130 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTF4P34130 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTF4P34130 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTF4P34130 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTF4P34130 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTF4P34130 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTF4P34130 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NTF4P34130 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NTF4P34130 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NTF4P34130 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTF4P34130 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTF4P34130 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTF4P34130 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTF4P34130 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTF4P34130 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTF4P34130 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTF4P34130 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTF4P34130 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTF4P34130 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTF4P34130 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTF4P34130 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTF4P34130 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTF4P34130 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTF4P34130 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTF4P34130 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NTF4P34130 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTF4P34130 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTF4P34130 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTF4P34130 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTF4P34130 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTF4P34130 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTF4P34130 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTF4P34130 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTF4P34130 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTF4P34130 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NTF4P34130 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTF4P34130 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTF4P34130 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NTF4P34130 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTF4P34130 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTF4P34130 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTF4P34130 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTF4P34130 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NTF4P34130 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTF4P34130 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTF4P34130 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTF4P34130 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTF4P34130 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTF4P34130 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NTF4P34130 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NTF4P34130 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTF4P34130 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTF4P34130 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTF4P34130 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTF4P34130 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTF4P34130 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTF4P34130 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NTF4P34130 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTF4P34130 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTF4P34130 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTF4P34130 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTF4P34130 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTF4P34130 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTF4P34130 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTF4P34130 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTF4P34130 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTF4P34130 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NTF4P34130 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTF4P34130 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTF4P34130 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTF4P34130 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTF4P34130 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTF4P34130 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTF4P34130 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTF4P34130 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTF4P34130 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTF4P34130 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTF4P34130 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTF4P34130 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTF4P34130 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTF4P34130 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTF4P34130 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms