Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CASQ1P31415 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CASQ1P31415 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CASQ1P31415 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CASQ1P31415 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CASQ1P31415 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CASQ1P31415 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CASQ1P31415 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CASQ1P31415 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CASQ1P31415 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CASQ1P31415 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CASQ1P31415 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CASQ1P31415 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CASQ1P31415 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CASQ1P31415 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CASQ1P31415 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CASQ1P31415 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CASQ1P31415 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CASQ1P31415 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CASQ1P31415 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CASQ1P31415 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CASQ1P31415 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CASQ1P31415 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CASQ1P31415 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CASQ1P31415 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CASQ1P31415 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CASQ1P31415 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CASQ1P31415 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CASQ1P31415 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CASQ1P31415 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CASQ1P31415 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CASQ1P31415 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CASQ1P31415 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CASQ1P31415 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CASQ1P31415 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CASQ1P31415 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CASQ1P31415 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CASQ1P31415 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CASQ1P31415 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CASQ1P31415 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CASQ1P31415 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CASQ1P31415 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CASQ1P31415 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CASQ1P31415 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CASQ1P31415 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CASQ1P31415 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CASQ1P31415 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASQ1P31415 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASQ1P31415 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASQ1P31415 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CASQ1P31415 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CASQ1P31415 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CASQ1P31415 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CASQ1P31415 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CASQ1P31415 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CASQ1P31415 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CASQ1P31415 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASQ1P31415 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CASQ1P31415 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CASQ1P31415 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CASQ1P31415 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASQ1P31415 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASQ1P31415 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASQ1P31415 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASQ1P31415 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASQ1P31415 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASQ1P31415 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASQ1P31415 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASQ1P31415 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CASQ1P31415 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CASQ1P31415 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CASQ1P31415 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASQ1P31415 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASQ1P31415 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASQ1P31415 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASQ1P31415 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CASQ1P31415 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASQ1P31415 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASQ1P31415 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CASQ1P31415 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASQ1P31415 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASQ1P31415 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASQ1P31415 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASQ1P31415 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASQ1P31415 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASQ1P31415 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASQ1P31415 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CASQ1P31415 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASQ1P31415 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASQ1P31415 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASQ1P31415 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CASQ1P31415 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CASQ1P31415 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CASQ1P31415 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASQ1P31415 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CASQ1P31415 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CASQ1P31415 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CASQ1P31415 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CASQ1P31415 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASQ1P31415 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms