Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSPOP30536 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSPOP30536 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSPOP30536 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSPOP30536 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSPOP30536 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSPOP30536 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSPOP30536 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSPOP30536 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSPOP30536 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSPOP30536 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSPOP30536 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSPOP30536 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSPOP30536 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPOP30536 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPOP30536 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSPOP30536 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSPOP30536 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSPOP30536 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSPOP30536 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSPOP30536 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSPOP30536 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSPOP30536 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSPOP30536 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSPOP30536 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSPOP30536 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSPOP30536 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSPOP30536 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSPOP30536 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSPOP30536 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSPOP30536 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TSPOP30536 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSPOP30536 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSPOP30536 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSPOP30536 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSPOP30536 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSPOP30536 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSPOP30536 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSPOP30536 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSPOP30536 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSPOP30536 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSPOP30536 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSPOP30536 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSPOP30536 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSPOP30536 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSPOP30536 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSPOP30536 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSPOP30536 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSPOP30536 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSPOP30536 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSPOP30536 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSPOP30536 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSPOP30536 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSPOP30536 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSPOP30536 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSPOP30536 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSPOP30536 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSPOP30536 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSPOP30536 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSPOP30536 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSPOP30536 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TSPOP30536 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TSPOP30536 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSPOP30536 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSPOP30536 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSPOP30536 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPOP30536 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPOP30536 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPOP30536 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSPOP30536 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSPOP30536 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSPOP30536 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TSPOP30536 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSPOP30536 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSPOP30536 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSPOP30536 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSPOP30536 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TSPOP30536 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSPOP30536 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSPOP30536 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSPOP30536 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSPOP30536 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSPOP30536 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSPOP30536 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSPOP30536 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSPOP30536 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSPOP30536 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPOP30536 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPOP30536 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPOP30536 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPOP30536 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPOP30536 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPOP30536 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPOP30536 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPOP30536 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPOP30536 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPOP30536 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPOP30536 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPOP30536 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPOP30536 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms