Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SERPINB3P29508 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SERPINB3P29508 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SERPINB3P29508 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SERPINB3P29508 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SERPINB3P29508 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SERPINB3P29508 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SERPINB3P29508 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SERPINB3P29508 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SERPINB3P29508 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SERPINB3P29508 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SERPINB3P29508 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SERPINB3P29508 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SERPINB3P29508 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SERPINB3P29508 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SERPINB3P29508 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SERPINB3P29508 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SERPINB3P29508 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SERPINB3P29508 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SERPINB3P29508 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SERPINB3P29508 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SERPINB3P29508 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SERPINB3P29508 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SERPINB3P29508 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SERPINB3P29508 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SERPINB3P29508 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SERPINB3P29508 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SERPINB3P29508 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SERPINB3P29508 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SERPINB3P29508 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SERPINB3P29508 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SERPINB3P29508 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SERPINB3P29508 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SERPINB3P29508 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SERPINB3P29508 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SERPINB3P29508 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SERPINB3P29508 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SERPINB3P29508 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SERPINB3P29508 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SERPINB3P29508 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SERPINB3P29508 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SERPINB3P29508 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SERPINB3P29508 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SERPINB3P29508 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SERPINB3P29508 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SERPINB3P29508 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SERPINB3P29508 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SERPINB3P29508 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SERPINB3P29508 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SERPINB3P29508 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERPINB3P29508 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERPINB3P29508 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SERPINB3P29508 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SERPINB3P29508 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SERPINB3P29508 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SERPINB3P29508 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SERPINB3P29508 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SERPINB3P29508 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SERPINB3P29508 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SERPINB3P29508 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SERPINB3P29508 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SERPINB3P29508 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SERPINB3P29508 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SERPINB3P29508 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SERPINB3P29508 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SERPINB3P29508 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SERPINB3P29508 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SERPINB3P29508 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SERPINB3P29508 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SERPINB3P29508 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SERPINB3P29508 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SERPINB3P29508 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SERPINB3P29508 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SERPINB3P29508 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SERPINB3P29508 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SERPINB3P29508 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SERPINB3P29508 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SERPINB3P29508 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SERPINB3P29508 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SERPINB3P29508 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SERPINB3P29508 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SERPINB3P29508 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SERPINB3P29508 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SERPINB3P29508 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SERPINB3P29508 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SERPINB3P29508 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SERPINB3P29508 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SERPINB3P29508 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SERPINB3P29508 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SERPINB3P29508 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SERPINB3P29508 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SERPINB3P29508 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SERPINB3P29508 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SERPINB3P29508 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SERPINB3P29508 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SERPINB3P29508 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SERPINB3P29508 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SERPINB3P29508 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SERPINB3P29508 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SERPINB3P29508 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms