Protein–RNA interactions for Protein: P28072

PSMB6, Proteasome subunit beta type-6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB6P28072 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB6P28072 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB6P28072 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB6P28072 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMB6P28072 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMB6P28072 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB6P28072 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB6P28072 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB6P28072 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB6P28072 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB6P28072 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB6P28072 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB6P28072 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB6P28072 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB6P28072 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB6P28072 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB6P28072 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB6P28072 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB6P28072 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB6P28072 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB6P28072 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB6P28072 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB6P28072 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB6P28072 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB6P28072 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB6P28072 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB6P28072 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB6P28072 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB6P28072 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB6P28072 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB6P28072 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB6P28072 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB6P28072 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB6P28072 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB6P28072 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB6P28072 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB6P28072 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB6P28072 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB6P28072 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB6P28072 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMB6P28072 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMB6P28072 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB6P28072 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMB6P28072 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMB6P28072 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMB6P28072 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMB6P28072 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMB6P28072 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB6P28072 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB6P28072 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB6P28072 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB6P28072 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB6P28072 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB6P28072 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB6P28072 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB6P28072 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB6P28072 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB6P28072 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB6P28072 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB6P28072 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB6P28072 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB6P28072 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB6P28072 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB6P28072 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB6P28072 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB6P28072 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB6P28072 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB6P28072 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB6P28072 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB6P28072 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB6P28072 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB6P28072 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB6P28072 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB6P28072 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB6P28072 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB6P28072 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB6P28072 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMB6P28072 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMB6P28072 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB6P28072 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB6P28072 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB6P28072 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB6P28072 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB6P28072 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB6P28072 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB6P28072 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB6P28072 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB6P28072 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB6P28072 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB6P28072 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB6P28072 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB6P28072 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB6P28072 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB6P28072 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB6P28072 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB6P28072 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB6P28072 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB6P28072 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB6P28072 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB6P28072 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms