Protein–RNA interactions for Protein: P27986

PIK3R1, Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R1P27986 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIK3R1P27986 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIK3R1P27986 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIK3R1P27986 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PIK3R1P27986 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PIK3R1P27986 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIK3R1P27986 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PIK3R1P27986 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PIK3R1P27986 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3R1P27986 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3R1P27986 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3R1P27986 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3R1P27986 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIK3R1P27986 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIK3R1P27986 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3R1P27986 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R1P27986 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R1P27986 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3R1P27986 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R1P27986 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3R1P27986 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R1P27986 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3R1P27986 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3R1P27986 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIK3R1P27986 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIK3R1P27986 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3R1P27986 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3R1P27986 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3R1P27986 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3R1P27986 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIK3R1P27986 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIK3R1P27986 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3R1P27986 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3R1P27986 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3R1P27986 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3R1P27986 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3R1P27986 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3R1P27986 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R1P27986 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R1P27986 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3R1P27986 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3R1P27986 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R1P27986 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R1P27986 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3R1P27986 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3R1P27986 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3R1P27986 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3R1P27986 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3R1P27986 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3R1P27986 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3R1P27986 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3R1P27986 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3R1P27986 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3R1P27986 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3R1P27986 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3R1P27986 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3R1P27986 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3R1P27986 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3R1P27986 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3R1P27986 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3R1P27986 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3R1P27986 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3R1P27986 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3R1P27986 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3R1P27986 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3R1P27986 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3R1P27986 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3R1P27986 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3R1P27986 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIK3R1P27986 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIK3R1P27986 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIK3R1P27986 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PIK3R1P27986 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PIK3R1P27986 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PIK3R1P27986 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PIK3R1P27986 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PIK3R1P27986 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PIK3R1P27986 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R1P27986 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R1P27986 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R1P27986 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R1P27986 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R1P27986 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R1P27986 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R1P27986 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R1P27986 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R1P27986 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3R1P27986 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIK3R1P27986 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIK3R1P27986 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIK3R1P27986 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PIK3R1P27986 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIK3R1P27986 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIK3R1P27986 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIK3R1P27986 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PIK3R1P27986 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PIK3R1P27986 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIK3R1P27986 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIK3R1P27986 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIK3R1P27986 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.4 ms