Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK2P24941 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK2P24941 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK2P24941 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK2P24941 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK2P24941 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK2P24941 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK2P24941 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK2P24941 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK2P24941 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK2P24941 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK2P24941 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK2P24941 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK2P24941 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK2P24941 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK2P24941 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK2P24941 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK2P24941 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK2P24941 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK2P24941 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK2P24941 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK2P24941 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK2P24941 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK2P24941 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK2P24941 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK2P24941 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK2P24941 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK2P24941 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK2P24941 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK2P24941 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK2P24941 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK2P24941 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK2P24941 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK2P24941 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK2P24941 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK2P24941 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK2P24941 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK2P24941 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK2P24941 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK2P24941 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK2P24941 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK2P24941 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK2P24941 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK2P24941 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK2P24941 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK2P24941 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK2P24941 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK2P24941 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK2P24941 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK2P24941 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK2P24941 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK2P24941 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK2P24941 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK2P24941 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK2P24941 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK2P24941 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK2P24941 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK2P24941 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK2P24941 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK2P24941 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK2P24941 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK2P24941 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK2P24941 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK2P24941 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK2P24941 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK2P24941 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK2P24941 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK2P24941 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK2P24941 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK2P24941 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK2P24941 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK2P24941 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK2P24941 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK2P24941 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK2P24941 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK2P24941 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK2P24941 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK2P24941 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK2P24941 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK2P24941 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK2P24941 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK2P24941 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK2P24941 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK2P24941 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK2P24941 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK2P24941 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK2P24941 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK2P24941 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK2P24941 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK2P24941 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK2P24941 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK2P24941 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK2P24941 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK2P24941 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK2P24941 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK2P24941 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK2P24941 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK2P24941 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK2P24941 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK2P24941 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms