Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK2P24941 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK2P24941 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK2P24941 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK2P24941 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK2P24941 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK2P24941 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK2P24941 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK2P24941 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK2P24941 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK2P24941 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK2P24941 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK2P24941 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK2P24941 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK2P24941 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK2P24941 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK2P24941 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK2P24941 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK2P24941 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK2P24941 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK2P24941 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK2P24941 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK2P24941 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK2P24941 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK2P24941 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK2P24941 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK2P24941 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK2P24941 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK2P24941 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK2P24941 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK2P24941 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK2P24941 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK2P24941 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK2P24941 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK2P24941 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK2P24941 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK2P24941 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK2P24941 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK2P24941 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK2P24941 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK2P24941 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK2P24941 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK2P24941 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK2P24941 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK2P24941 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK2P24941 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK2P24941 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK2P24941 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK2P24941 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK2P24941 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK2P24941 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK2P24941 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK2P24941 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK2P24941 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK2P24941 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK2P24941 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK2P24941 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK2P24941 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK2P24941 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK2P24941 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK2P24941 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK2P24941 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK2P24941 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK2P24941 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK2P24941 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK2P24941 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK2P24941 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK2P24941 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK2P24941 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK2P24941 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK2P24941 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK2P24941 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK2P24941 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK2P24941 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK2P24941 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK2P24941 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK2P24941 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK2P24941 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK2P24941 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK2P24941 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK2P24941 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK2P24941 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK2P24941 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK2P24941 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK2P24941 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK2P24941 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK2P24941 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK2P24941 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK2P24941 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK2P24941 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK2P24941 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK2P24941 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK2P24941 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK2P24941 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK2P24941 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK2P24941 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK2P24941 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK2P24941 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK2P24941 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK2P24941 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms