Protein–RNA interactions for Protein: P23528

CFL1, Cofilin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFL1P23528 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFL1P23528 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFL1P23528 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFL1P23528 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFL1P23528 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFL1P23528 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFL1P23528 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFL1P23528 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFL1P23528 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFL1P23528 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFL1P23528 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFL1P23528 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFL1P23528 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFL1P23528 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CFL1P23528 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFL1P23528 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFL1P23528 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFL1P23528 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFL1P23528 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFL1P23528 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFL1P23528 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFL1P23528 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFL1P23528 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFL1P23528 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFL1P23528 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFL1P23528 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFL1P23528 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFL1P23528 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFL1P23528 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFL1P23528 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFL1P23528 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFL1P23528 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFL1P23528 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFL1P23528 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFL1P23528 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CFL1P23528 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CFL1P23528 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFL1P23528 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFL1P23528 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFL1P23528 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFL1P23528 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFL1P23528 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFL1P23528 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFL1P23528 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFL1P23528 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFL1P23528 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFL1P23528 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFL1P23528 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CFL1P23528 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFL1P23528 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFL1P23528 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFL1P23528 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFL1P23528 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFL1P23528 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFL1P23528 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFL1P23528 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFL1P23528 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CFL1P23528 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFL1P23528 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CFL1P23528 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFL1P23528 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFL1P23528 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFL1P23528 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFL1P23528 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFL1P23528 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFL1P23528 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFL1P23528 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFL1P23528 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFL1P23528 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFL1P23528 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFL1P23528 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFL1P23528 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFL1P23528 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFL1P23528 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFL1P23528 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFL1P23528 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFL1P23528 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFL1P23528 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFL1P23528 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFL1P23528 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFL1P23528 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFL1P23528 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFL1P23528 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFL1P23528 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFL1P23528 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFL1P23528 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFL1P23528 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFL1P23528 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFL1P23528 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFL1P23528 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFL1P23528 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFL1P23528 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFL1P23528 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFL1P23528 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFL1P23528 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFL1P23528 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFL1P23528 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFL1P23528 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFL1P23528 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFL1P23528 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms