Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SP100P23497 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SP100P23497 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SP100P23497 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SP100P23497 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SP100P23497 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SP100P23497 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SP100P23497 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SP100P23497 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SP100P23497 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SP100P23497 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SP100P23497 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SP100P23497 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SP100P23497 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SP100P23497 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SP100P23497 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SP100P23497 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SP100P23497 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SP100P23497 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SP100P23497 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SP100P23497 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SP100P23497 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SP100P23497 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SP100P23497 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SP100P23497 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SP100P23497 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SP100P23497 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SP100P23497 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SP100P23497 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SP100P23497 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SP100P23497 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SP100P23497 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SP100P23497 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SP100P23497 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SP100P23497 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SP100P23497 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SP100P23497 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SP100P23497 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SP100P23497 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SP100P23497 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SP100P23497 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SP100P23497 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SP100P23497 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SP100P23497 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SP100P23497 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SP100P23497 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SP100P23497 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SP100P23497 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SP100P23497 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SP100P23497 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SP100P23497 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SP100P23497 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SP100P23497 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SP100P23497 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SP100P23497 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SP100P23497 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SP100P23497 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SP100P23497 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SP100P23497 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SP100P23497 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SP100P23497 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SP100P23497 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SP100P23497 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SP100P23497 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SP100P23497 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SP100P23497 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SP100P23497 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SP100P23497 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SP100P23497 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SP100P23497 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SP100P23497 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SP100P23497 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SP100P23497 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SP100P23497 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SP100P23497 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SP100P23497 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SP100P23497 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SP100P23497 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SP100P23497 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SP100P23497 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SP100P23497 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SP100P23497 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SP100P23497 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SP100P23497 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SP100P23497 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SP100P23497 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SP100P23497 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SP100P23497 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SP100P23497 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SP100P23497 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SP100P23497 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SP100P23497 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SP100P23497 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SP100P23497 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SP100P23497 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SP100P23497 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SP100P23497 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SP100P23497 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SP100P23497 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SP100P23497 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms