Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NF1P21359 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NF1P21359 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NF1P21359 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NF1P21359 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF1P21359 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF1P21359 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NF1P21359 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF1P21359 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NF1P21359 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NF1P21359 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NF1P21359 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NF1P21359 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NF1P21359 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NF1P21359 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NF1P21359 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NF1P21359 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF1P21359 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF1P21359 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF1P21359 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NF1P21359 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NF1P21359 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NF1P21359 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NF1P21359 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NF1P21359 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NF1P21359 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NF1P21359 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NF1P21359 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NF1P21359 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NF1P21359 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NF1P21359 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NF1P21359 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NF1P21359 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NF1P21359 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NF1P21359 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NF1P21359 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NF1P21359 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NF1P21359 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NF1P21359 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NF1P21359 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NF1P21359 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NF1P21359 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NF1P21359 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NF1P21359 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NF1P21359 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NF1P21359 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NF1P21359 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NF1P21359 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NF1P21359 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NF1P21359 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NF1P21359 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NF1P21359 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NF1P21359 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NF1P21359 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NF1P21359 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NF1P21359 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NF1P21359 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NF1P21359 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NF1P21359 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NF1P21359 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NF1P21359 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF1P21359 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF1P21359 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF1P21359 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NF1P21359 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NF1P21359 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NF1P21359 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NF1P21359 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NF1P21359 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NF1P21359 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NF1P21359 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NF1P21359 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NF1P21359 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NF1P21359 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NF1P21359 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NF1P21359 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NF1P21359 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NF1P21359 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NF1P21359 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NF1P21359 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NF1P21359 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NF1P21359 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NF1P21359 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NF1P21359 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF1P21359 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF1P21359 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF1P21359 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NF1P21359 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NF1P21359 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NF1P21359 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NF1P21359 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NF1P21359 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NF1P21359 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NF1P21359 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF1P21359 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NF1P21359 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF1P21359 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF1P21359 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF1P21359 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NF1P21359 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms