Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CDK11BP21127 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CDK11BP21127 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CDK11BP21127 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CDK11BP21127 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CDK11BP21127 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CDK11BP21127 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CDK11BP21127 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CDK11BP21127 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CDK11BP21127 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CDK11BP21127 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CDK11BP21127 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CDK11BP21127 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CDK11BP21127 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CDK11BP21127 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CDK11BP21127 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CDK11BP21127 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CDK11BP21127 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDK11BP21127 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK11BP21127 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK11BP21127 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK11BP21127 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK11BP21127 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK11BP21127 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK11BP21127 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK11BP21127 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK11BP21127 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK11BP21127 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK11BP21127 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK11BP21127 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK11BP21127 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK11BP21127 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CDK11BP21127 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CDK11BP21127 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDK11BP21127 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK11BP21127 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK11BP21127 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK11BP21127 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK11BP21127 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDK11BP21127 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK11BP21127 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK11BP21127 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CDK11BP21127 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CDK11BP21127 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK11BP21127 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK11BP21127 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK11BP21127 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK11BP21127 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK11BP21127 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK11BP21127 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK11BP21127 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK11BP21127 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK11BP21127 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK11BP21127 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK11BP21127 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK11BP21127 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK11BP21127 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK11BP21127 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK11BP21127 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK11BP21127 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK11BP21127 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDK11BP21127 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK11BP21127 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK11BP21127 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDK11BP21127 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK11BP21127 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK11BP21127 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK11BP21127 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK11BP21127 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CDK11BP21127 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK11BP21127 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK11BP21127 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK11BP21127 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK11BP21127 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK11BP21127 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK11BP21127 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK11BP21127 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK11BP21127 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDK11BP21127 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDK11BP21127 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK11BP21127 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK11BP21127 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK11BP21127 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK11BP21127 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK11BP21127 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CDK11BP21127 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CDK11BP21127 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CDK11BP21127 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CDK11BP21127 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
CDK11BP21127 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CDK11BP21127 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CDK11BP21127 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CDK11BP21127 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CDK11BP21127 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CDK11BP21127 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CDK11BP21127 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK11BP21127 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDK11BP21127 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDK11BP21127 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDK11BP21127 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms