Protein–RNA interactions for Protein: P20962

PTMS, Parathymosin, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMSP20962 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTMSP20962 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTMSP20962 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTMSP20962 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTMSP20962 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTMSP20962 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTMSP20962 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTMSP20962 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTMSP20962 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTMSP20962 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTMSP20962 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTMSP20962 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTMSP20962 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTMSP20962 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PTMSP20962 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTMSP20962 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTMSP20962 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTMSP20962 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTMSP20962 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTMSP20962 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTMSP20962 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTMSP20962 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTMSP20962 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PTMSP20962 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTMSP20962 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTMSP20962 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
PTMSP20962 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTMSP20962 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTMSP20962 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTMSP20962 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTMSP20962 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTMSP20962 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTMSP20962 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTMSP20962 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTMSP20962 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTMSP20962 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTMSP20962 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTMSP20962 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTMSP20962 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTMSP20962 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTMSP20962 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTMSP20962 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTMSP20962 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTMSP20962 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTMSP20962 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTMSP20962 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTMSP20962 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTMSP20962 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTMSP20962 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTMSP20962 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PTMSP20962 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTMSP20962 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTMSP20962 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTMSP20962 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTMSP20962 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTMSP20962 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTMSP20962 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTMSP20962 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTMSP20962 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTMSP20962 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTMSP20962 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTMSP20962 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PTMSP20962 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTMSP20962 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTMSP20962 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTMSP20962 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTMSP20962 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTMSP20962 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTMSP20962 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTMSP20962 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTMSP20962 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTMSP20962 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTMSP20962 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTMSP20962 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTMSP20962 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTMSP20962 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTMSP20962 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTMSP20962 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTMSP20962 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTMSP20962 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTMSP20962 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTMSP20962 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTMSP20962 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTMSP20962 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTMSP20962 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTMSP20962 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTMSP20962 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTMSP20962 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTMSP20962 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTMSP20962 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTMSP20962 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTMSP20962 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTMSP20962 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTMSP20962 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTMSP20962 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTMSP20962 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTMSP20962 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTMSP20962 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTMSP20962 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
PTMSP20962 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms