Protein–RNA interactions for Protein: P19878

NCF2, Neutrophil cytosol factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF2P19878 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCF2P19878 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCF2P19878 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCF2P19878 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCF2P19878 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCF2P19878 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCF2P19878 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCF2P19878 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCF2P19878 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NCF2P19878 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCF2P19878 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCF2P19878 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCF2P19878 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCF2P19878 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCF2P19878 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCF2P19878 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCF2P19878 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCF2P19878 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCF2P19878 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCF2P19878 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCF2P19878 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCF2P19878 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCF2P19878 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCF2P19878 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCF2P19878 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCF2P19878 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NCF2P19878 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCF2P19878 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCF2P19878 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NCF2P19878 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCF2P19878 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NCF2P19878 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCF2P19878 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCF2P19878 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCF2P19878 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCF2P19878 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCF2P19878 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCF2P19878 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCF2P19878 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCF2P19878 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCF2P19878 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCF2P19878 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCF2P19878 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCF2P19878 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCF2P19878 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCF2P19878 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCF2P19878 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCF2P19878 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCF2P19878 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NCF2P19878 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCF2P19878 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCF2P19878 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCF2P19878 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCF2P19878 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCF2P19878 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCF2P19878 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCF2P19878 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCF2P19878 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCF2P19878 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCF2P19878 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCF2P19878 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NCF2P19878 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCF2P19878 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCF2P19878 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCF2P19878 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCF2P19878 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCF2P19878 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCF2P19878 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCF2P19878 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCF2P19878 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCF2P19878 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCF2P19878 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCF2P19878 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCF2P19878 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCF2P19878 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCF2P19878 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCF2P19878 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCF2P19878 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCF2P19878 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCF2P19878 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCF2P19878 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCF2P19878 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCF2P19878 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCF2P19878 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCF2P19878 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCF2P19878 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCF2P19878 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCF2P19878 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCF2P19878 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCF2P19878 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCF2P19878 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCF2P19878 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCF2P19878 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCF2P19878 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCF2P19878 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCF2P19878 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NCF2P19878 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCF2P19878 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCF2P19878 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCF2P19878 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms