Protein–RNA interactions for Protein: P19419

ELK1, ETS domain-containing protein Elk-1, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1P19419 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELK1P19419 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELK1P19419 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELK1P19419 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELK1P19419 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELK1P19419 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELK1P19419 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELK1P19419 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELK1P19419 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELK1P19419 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ELK1P19419 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELK1P19419 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELK1P19419 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELK1P19419 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELK1P19419 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELK1P19419 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELK1P19419 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ELK1P19419 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELK1P19419 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELK1P19419 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELK1P19419 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELK1P19419 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELK1P19419 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELK1P19419 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELK1P19419 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELK1P19419 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELK1P19419 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELK1P19419 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELK1P19419 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELK1P19419 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELK1P19419 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELK1P19419 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELK1P19419 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELK1P19419 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELK1P19419 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELK1P19419 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELK1P19419 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELK1P19419 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELK1P19419 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ELK1P19419 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ELK1P19419 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ELK1P19419 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ELK1P19419 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ELK1P19419 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ELK1P19419 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ELK1P19419 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ELK1P19419 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ELK1P19419 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ELK1P19419 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELK1P19419 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELK1P19419 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ELK1P19419 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELK1P19419 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ELK1P19419 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ELK1P19419 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELK1P19419 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELK1P19419 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELK1P19419 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELK1P19419 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELK1P19419 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELK1P19419 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELK1P19419 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELK1P19419 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELK1P19419 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ELK1P19419 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ELK1P19419 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELK1P19419 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELK1P19419 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELK1P19419 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELK1P19419 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ELK1P19419 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ELK1P19419 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ELK1P19419 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ELK1P19419 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ELK1P19419 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ELK1P19419 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ELK1P19419 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ELK1P19419 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ELK1P19419 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ELK1P19419 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ELK1P19419 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ELK1P19419 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ELK1P19419 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ELK1P19419 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ELK1P19419 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ELK1P19419 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ELK1P19419 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ELK1P19419 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ELK1P19419 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ELK1P19419 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ELK1P19419 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ELK1P19419 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ELK1P19419 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ELK1P19419 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ELK1P19419 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ELK1P19419 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ELK1P19419 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELK1P19419 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELK1P19419 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELK1P19419 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms