Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRB1P18505 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRB1P18505 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRB1P18505 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRB1P18505 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRB1P18505 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRB1P18505 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRB1P18505 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRB1P18505 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRB1P18505 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRB1P18505 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRB1P18505 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRB1P18505 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRB1P18505 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRB1P18505 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRB1P18505 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRB1P18505 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABRB1P18505 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRB1P18505 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRB1P18505 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRB1P18505 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRB1P18505 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABRB1P18505 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABRB1P18505 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABRB1P18505 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABRB1P18505 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABRB1P18505 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRB1P18505 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRB1P18505 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABRB1P18505 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABRB1P18505 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABRB1P18505 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABRB1P18505 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRB1P18505 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRB1P18505 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRB1P18505 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRB1P18505 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRB1P18505 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRB1P18505 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRB1P18505 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRB1P18505 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRB1P18505 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRB1P18505 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRB1P18505 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRB1P18505 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRB1P18505 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GABRB1P18505 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRB1P18505 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRB1P18505 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRB1P18505 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRB1P18505 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRB1P18505 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRB1P18505 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRB1P18505 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRB1P18505 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRB1P18505 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRB1P18505 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRB1P18505 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRB1P18505 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GABRB1P18505 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GABRB1P18505 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRB1P18505 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRB1P18505 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRB1P18505 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRB1P18505 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRB1P18505 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRB1P18505 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRB1P18505 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRB1P18505 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRB1P18505 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRB1P18505 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRB1P18505 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRB1P18505 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRB1P18505 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRB1P18505 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRB1P18505 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRB1P18505 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRB1P18505 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRB1P18505 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRB1P18505 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRB1P18505 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRB1P18505 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRB1P18505 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRB1P18505 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRB1P18505 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRB1P18505 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRB1P18505 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRB1P18505 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRB1P18505 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRB1P18505 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRB1P18505 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRB1P18505 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRB1P18505 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRB1P18505 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRB1P18505 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRB1P18505 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRB1P18505 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRB1P18505 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRB1P18505 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRB1P18505 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms