Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA2P17301 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA2P17301 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA2P17301 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA2P17301 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA2P17301 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA2P17301 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA2P17301 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA2P17301 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ITGA2P17301 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA2P17301 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA2P17301 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA2P17301 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA2P17301 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA2P17301 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA2P17301 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA2P17301 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA2P17301 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA2P17301 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA2P17301 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA2P17301 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA2P17301 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA2P17301 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA2P17301 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA2P17301 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA2P17301 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA2P17301 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA2P17301 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA2P17301 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA2P17301 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA2P17301 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA2P17301 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA2P17301 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA2P17301 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA2P17301 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA2P17301 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA2P17301 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA2P17301 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA2P17301 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA2P17301 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA2P17301 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA2P17301 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA2P17301 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA2P17301 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA2P17301 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA2P17301 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA2P17301 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA2P17301 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA2P17301 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITGA2P17301 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA2P17301 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA2P17301 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA2P17301 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA2P17301 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA2P17301 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA2P17301 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA2P17301 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA2P17301 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA2P17301 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA2P17301 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA2P17301 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA2P17301 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGA2P17301 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA2P17301 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA2P17301 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA2P17301 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA2P17301 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA2P17301 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA2P17301 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA2P17301 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA2P17301 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA2P17301 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA2P17301 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA2P17301 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA2P17301 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA2P17301 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA2P17301 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA2P17301 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA2P17301 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA2P17301 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA2P17301 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA2P17301 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA2P17301 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA2P17301 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA2P17301 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA2P17301 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA2P17301 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA2P17301 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA2P17301 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA2P17301 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA2P17301 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA2P17301 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA2P17301 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA2P17301 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA2P17301 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA2P17301 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA2P17301 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA2P17301 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA2P17301 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA2P17301 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms