Protein–RNA interactions for Protein: P15927

RPA2, Replication protein A 32 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA2P15927 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPA2P15927 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPA2P15927 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPA2P15927 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPA2P15927 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPA2P15927 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPA2P15927 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPA2P15927 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPA2P15927 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPA2P15927 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPA2P15927 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPA2P15927 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPA2P15927 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPA2P15927 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPA2P15927 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPA2P15927 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPA2P15927 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPA2P15927 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPA2P15927 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPA2P15927 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPA2P15927 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPA2P15927 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPA2P15927 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPA2P15927 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPA2P15927 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPA2P15927 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPA2P15927 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPA2P15927 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPA2P15927 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPA2P15927 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA2P15927 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA2P15927 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPA2P15927 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPA2P15927 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPA2P15927 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPA2P15927 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPA2P15927 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPA2P15927 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPA2P15927 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPA2P15927 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPA2P15927 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPA2P15927 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPA2P15927 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPA2P15927 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPA2P15927 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPA2P15927 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPA2P15927 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPA2P15927 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPA2P15927 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPA2P15927 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPA2P15927 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPA2P15927 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA2P15927 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPA2P15927 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RPA2P15927 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPA2P15927 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPA2P15927 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPA2P15927 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPA2P15927 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPA2P15927 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPA2P15927 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPA2P15927 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPA2P15927 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA2P15927 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA2P15927 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA2P15927 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA2P15927 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA2P15927 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA2P15927 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA2P15927 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA2P15927 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA2P15927 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA2P15927 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA2P15927 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA2P15927 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA2P15927 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA2P15927 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPA2P15927 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPA2P15927 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA2P15927 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA2P15927 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA2P15927 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPA2P15927 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPA2P15927 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPA2P15927 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA2P15927 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA2P15927 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPA2P15927 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPA2P15927 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPA2P15927 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPA2P15927 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA2P15927 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA2P15927 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA2P15927 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA2P15927 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA2P15927 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPA2P15927 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA2P15927 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA2P15927 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPA2P15927 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms