Protein–RNA interactions for Protein: P15313

ATP6V1B1, V-type proton ATPase subunit B, kidney isoform, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B1P15313 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP6V1B1P15313 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP6V1B1P15313 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP6V1B1P15313 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP6V1B1P15313 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP6V1B1P15313 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP6V1B1P15313 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP6V1B1P15313 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP6V1B1P15313 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP6V1B1P15313 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP6V1B1P15313 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP6V1B1P15313 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP6V1B1P15313 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP6V1B1P15313 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP6V1B1P15313 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP6V1B1P15313 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP6V1B1P15313 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP6V1B1P15313 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6V1B1P15313 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP6V1B1P15313 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP6V1B1P15313 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP6V1B1P15313 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP6V1B1P15313 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP6V1B1P15313 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP6V1B1P15313 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP6V1B1P15313 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP6V1B1P15313 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP6V1B1P15313 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP6V1B1P15313 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP6V1B1P15313 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP6V1B1P15313 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP6V1B1P15313 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP6V1B1P15313 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP6V1B1P15313 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP6V1B1P15313 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP6V1B1P15313 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP6V1B1P15313 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP6V1B1P15313 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP6V1B1P15313 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP6V1B1P15313 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP6V1B1P15313 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP6V1B1P15313 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP6V1B1P15313 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP6V1B1P15313 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP6V1B1P15313 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP6V1B1P15313 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP6V1B1P15313 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP6V1B1P15313 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP6V1B1P15313 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP6V1B1P15313 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP6V1B1P15313 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP6V1B1P15313 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP6V1B1P15313 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP6V1B1P15313 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP6V1B1P15313 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP6V1B1P15313 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP6V1B1P15313 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP6V1B1P15313 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP6V1B1P15313 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP6V1B1P15313 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP6V1B1P15313 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP6V1B1P15313 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP6V1B1P15313 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP6V1B1P15313 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP6V1B1P15313 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP6V1B1P15313 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP6V1B1P15313 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP6V1B1P15313 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP6V1B1P15313 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP6V1B1P15313 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ATP6V1B1P15313 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP6V1B1P15313 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP6V1B1P15313 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP6V1B1P15313 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP6V1B1P15313 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP6V1B1P15313 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP6V1B1P15313 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP6V1B1P15313 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP6V1B1P15313 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP6V1B1P15313 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP6V1B1P15313 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP6V1B1P15313 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP6V1B1P15313 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP6V1B1P15313 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP6V1B1P15313 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP6V1B1P15313 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP6V1B1P15313 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP6V1B1P15313 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP6V1B1P15313 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP6V1B1P15313 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP6V1B1P15313 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP6V1B1P15313 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP6V1B1P15313 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP6V1B1P15313 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP6V1B1P15313 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP6V1B1P15313 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP6V1B1P15313 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP6V1B1P15313 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP6V1B1P15313 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP6V1B1P15313 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms