Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM6P0DI80 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM6P0DI80 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM6P0DI80 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM6P0DI80 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM6P0DI80 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM6P0DI80 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM6P0DI80 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM6P0DI80 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM6P0DI80 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM6P0DI80 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM6P0DI80 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM6P0DI80 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM6P0DI80 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM6P0DI80 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM6P0DI80 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM6P0DI80 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM6P0DI80 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM6P0DI80 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM6P0DI80 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM6P0DI80 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM6P0DI80 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM6P0DI80 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM6P0DI80 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM6P0DI80 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM6P0DI80 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM6P0DI80 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM6P0DI80 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM6P0DI80 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM6P0DI80 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM6P0DI80 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM6P0DI80 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM6P0DI80 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM6P0DI80 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM6P0DI80 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM6P0DI80 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM6P0DI80 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM6P0DI80 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM6P0DI80 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM6P0DI80 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM6P0DI80 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMIM6P0DI80 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM6P0DI80 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM6P0DI80 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM6P0DI80 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM6P0DI80 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM6P0DI80 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM6P0DI80 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM6P0DI80 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM6P0DI80 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM6P0DI80 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMIM6P0DI80 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SMIM6P0DI80 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SMIM6P0DI80 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM6P0DI80 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM6P0DI80 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM6P0DI80 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM6P0DI80 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM6P0DI80 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM6P0DI80 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM6P0DI80 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM6P0DI80 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM6P0DI80 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM6P0DI80 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM6P0DI80 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM6P0DI80 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMIM6P0DI80 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM6P0DI80 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM6P0DI80 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM6P0DI80 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM6P0DI80 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM6P0DI80 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM6P0DI80 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM6P0DI80 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM6P0DI80 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM6P0DI80 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMIM6P0DI80 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM6P0DI80 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM6P0DI80 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM6P0DI80 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM6P0DI80 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM6P0DI80 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM6P0DI80 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM6P0DI80 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM6P0DI80 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM6P0DI80 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM6P0DI80 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM6P0DI80 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM6P0DI80 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMIM6P0DI80 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMIM6P0DI80 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM6P0DI80 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM6P0DI80 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM6P0DI80 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM6P0DI80 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM6P0DI80 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM6P0DI80 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM6P0DI80 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM6P0DI80 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM6P0DI80 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms