Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00869P0C866 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00869P0C866 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00869P0C866 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00869P0C866 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00869P0C866 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00869P0C866 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00869P0C866 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00869P0C866 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00869P0C866 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00869P0C866 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00869P0C866 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINC00869P0C866 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00869P0C866 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00869P0C866 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00869P0C866 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00869P0C866 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00869P0C866 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00869P0C866 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00869P0C866 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00869P0C866 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00869P0C866 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00869P0C866 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00869P0C866 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00869P0C866 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00869P0C866 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00869P0C866 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00869P0C866 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00869P0C866 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00869P0C866 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00869P0C866 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00869P0C866 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00869P0C866 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00869P0C866 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00869P0C866 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00869P0C866 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00869P0C866 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00869P0C866 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00869P0C866 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00869P0C866 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00869P0C866 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00869P0C866 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00869P0C866 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00869P0C866 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00869P0C866 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00869P0C866 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00869P0C866 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00869P0C866 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00869P0C866 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00869P0C866 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00869P0C866 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00869P0C866 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00869P0C866 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00869P0C866 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00869P0C866 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00869P0C866 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00869P0C866 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00869P0C866 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00869P0C866 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00869P0C866 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00869P0C866 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00869P0C866 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00869P0C866 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00869P0C866 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00869P0C866 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00869P0C866 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00869P0C866 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00869P0C866 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00869P0C866 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00869P0C866 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00869P0C866 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00869P0C866 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00869P0C866 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00869P0C866 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00869P0C866 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00869P0C866 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00869P0C866 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00869P0C866 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00869P0C866 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00869P0C866 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LINC00869P0C866 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00869P0C866 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00869P0C866 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00869P0C866 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00869P0C866 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00869P0C866 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00869P0C866 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00869P0C866 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00869P0C866 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00869P0C866 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00869P0C866 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00869P0C866 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00869P0C866 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00869P0C866 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00869P0C866 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00869P0C866 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00869P0C866 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00869P0C866 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00869P0C866 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00869P0C866 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms