Protein–RNA interactions for Protein: P09486

SPARC, SPARC, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCP09486 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPARCP09486 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPARCP09486 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPARCP09486 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPARCP09486 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPARCP09486 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPARCP09486 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPARCP09486 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPARCP09486 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPARCP09486 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPARCP09486 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPARCP09486 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPARCP09486 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPARCP09486 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPARCP09486 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPARCP09486 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPARCP09486 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPARCP09486 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPARCP09486 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPARCP09486 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPARCP09486 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPARCP09486 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPARCP09486 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPARCP09486 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPARCP09486 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPARCP09486 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPARCP09486 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPARCP09486 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPARCP09486 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPARCP09486 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPARCP09486 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPARCP09486 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPARCP09486 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPARCP09486 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPARCP09486 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPARCP09486 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPARCP09486 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPARCP09486 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPARCP09486 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPARCP09486 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPARCP09486 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPARCP09486 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPARCP09486 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SPARCP09486 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPARCP09486 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPARCP09486 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPARCP09486 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPARCP09486 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPARCP09486 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPARCP09486 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPARCP09486 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPARCP09486 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPARCP09486 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPARCP09486 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPARCP09486 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPARCP09486 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPARCP09486 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPARCP09486 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPARCP09486 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPARCP09486 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPARCP09486 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPARCP09486 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPARCP09486 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPARCP09486 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPARCP09486 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPARCP09486 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPARCP09486 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPARCP09486 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPARCP09486 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPARCP09486 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPARCP09486 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPARCP09486 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPARCP09486 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPARCP09486 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPARCP09486 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPARCP09486 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPARCP09486 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPARCP09486 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPARCP09486 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPARCP09486 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPARCP09486 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPARCP09486 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPARCP09486 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPARCP09486 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPARCP09486 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPARCP09486 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPARCP09486 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPARCP09486 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPARCP09486 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPARCP09486 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPARCP09486 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPARCP09486 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPARCP09486 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPARCP09486 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPARCP09486 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPARCP09486 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPARCP09486 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPARCP09486 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPARCP09486 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPARCP09486 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms