Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP1A1P05023 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP1A1P05023 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP1A1P05023 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP1A1P05023 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP1A1P05023 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP1A1P05023 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP1A1P05023 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP1A1P05023 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP1A1P05023 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP1A1P05023 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP1A1P05023 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP1A1P05023 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP1A1P05023 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP1A1P05023 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP1A1P05023 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP1A1P05023 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP1A1P05023 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP1A1P05023 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP1A1P05023 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP1A1P05023 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP1A1P05023 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP1A1P05023 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP1A1P05023 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP1A1P05023 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP1A1P05023 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP1A1P05023 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP1A1P05023 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP1A1P05023 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP1A1P05023 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP1A1P05023 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP1A1P05023 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATP1A1P05023 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATP1A1P05023 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATP1A1P05023 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP1A1P05023 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP1A1P05023 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP1A1P05023 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP1A1P05023 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP1A1P05023 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP1A1P05023 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP1A1P05023 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP1A1P05023 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP1A1P05023 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP1A1P05023 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP1A1P05023 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP1A1P05023 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP1A1P05023 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP1A1P05023 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP1A1P05023 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP1A1P05023 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP1A1P05023 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP1A1P05023 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP1A1P05023 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP1A1P05023 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP1A1P05023 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP1A1P05023 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP1A1P05023 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP1A1P05023 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP1A1P05023 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP1A1P05023 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP1A1P05023 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP1A1P05023 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP1A1P05023 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP1A1P05023 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP1A1P05023 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP1A1P05023 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP1A1P05023 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP1A1P05023 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP1A1P05023 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP1A1P05023 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP1A1P05023 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP1A1P05023 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP1A1P05023 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP1A1P05023 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP1A1P05023 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP1A1P05023 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP1A1P05023 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP1A1P05023 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP1A1P05023 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP1A1P05023 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP1A1P05023 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP1A1P05023 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP1A1P05023 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP1A1P05023 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP1A1P05023 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP1A1P05023 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP1A1P05023 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP1A1P05023 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP1A1P05023 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP1A1P05023 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP1A1P05023 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP1A1P05023 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
ATP1A1P05023 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ATP1A1P05023 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP1A1P05023 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP1A1P05023 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP1A1P05023 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP1A1P05023 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP1A1P05023 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms