Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1P04632 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1P04632 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1P04632 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1P04632 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1P04632 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1P04632 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1P04632 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1P04632 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1P04632 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1P04632 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1P04632 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1P04632 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1P04632 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1P04632 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1P04632 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1P04632 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAPNS1P04632 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPNS1P04632 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPNS1P04632 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPNS1P04632 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPNS1P04632 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPNS1P04632 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CAPNS1P04632 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CAPNS1P04632 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CAPNS1P04632 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1P04632 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1P04632 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1P04632 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1P04632 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1P04632 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1P04632 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1P04632 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1P04632 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1P04632 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1P04632 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CAPNS1P04632 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1P04632 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1P04632 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1P04632 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1P04632 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1P04632 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1P04632 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1P04632 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1P04632 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1P04632 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1P04632 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1P04632 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1P04632 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1P04632 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1P04632 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1P04632 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1P04632 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1P04632 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1P04632 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1P04632 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1P04632 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1P04632 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1P04632 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1P04632 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1P04632 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1P04632 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1P04632 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1P04632 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1P04632 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1P04632 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1P04632 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1P04632 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1P04632 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1P04632 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1P04632 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1P04632 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1P04632 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1P04632 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1P04632 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1P04632 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1P04632 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1P04632 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1P04632 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1P04632 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1P04632 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1P04632 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1P04632 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1P04632 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1P04632 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1P04632 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1P04632 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1P04632 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1P04632 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1P04632 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1P04632 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1P04632 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1P04632 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1P04632 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1P04632 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1P04632 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1P04632 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1P04632 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1P04632 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1P04632 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms