Protein–RNA interactions for Protein: P04233

CD74, HLA class II histocompatibility antigen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD74P04233 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD74P04233 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD74P04233 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD74P04233 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD74P04233 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD74P04233 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD74P04233 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD74P04233 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD74P04233 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD74P04233 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD74P04233 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD74P04233 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CD74P04233 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD74P04233 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD74P04233 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD74P04233 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD74P04233 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD74P04233 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD74P04233 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD74P04233 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD74P04233 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD74P04233 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD74P04233 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CD74P04233 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD74P04233 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD74P04233 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD74P04233 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD74P04233 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD74P04233 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD74P04233 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD74P04233 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD74P04233 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD74P04233 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD74P04233 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD74P04233 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD74P04233 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD74P04233 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD74P04233 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD74P04233 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD74P04233 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD74P04233 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD74P04233 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD74P04233 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD74P04233 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD74P04233 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD74P04233 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD74P04233 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD74P04233 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD74P04233 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD74P04233 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD74P04233 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD74P04233 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD74P04233 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD74P04233 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD74P04233 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD74P04233 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD74P04233 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD74P04233 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CD74P04233 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD74P04233 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD74P04233 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD74P04233 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD74P04233 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD74P04233 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CD74P04233 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD74P04233 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD74P04233 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD74P04233 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD74P04233 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD74P04233 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD74P04233 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD74P04233 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD74P04233 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD74P04233 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD74P04233 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD74P04233 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD74P04233 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD74P04233 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD74P04233 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD74P04233 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD74P04233 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD74P04233 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD74P04233 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD74P04233 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD74P04233 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD74P04233 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD74P04233 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD74P04233 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD74P04233 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CD74P04233 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD74P04233 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD74P04233 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD74P04233 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD74P04233 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD74P04233 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD74P04233 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD74P04233 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD74P04233 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD74P04233 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD74P04233 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms