Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNA2P01563 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNA2P01563 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNA2P01563 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFNA2P01563 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFNA2P01563 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNA2P01563 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNA2P01563 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNA2P01563 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNA2P01563 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFNA2P01563 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNA2P01563 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNA2P01563 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNA2P01563 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFNA2P01563 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFNA2P01563 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNA2P01563 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNA2P01563 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNA2P01563 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNA2P01563 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNA2P01563 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNA2P01563 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNA2P01563 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNA2P01563 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNA2P01563 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNA2P01563 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNA2P01563 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNA2P01563 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNA2P01563 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNA2P01563 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNA2P01563 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNA2P01563 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNA2P01563 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNA2P01563 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNA2P01563 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNA2P01563 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNA2P01563 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNA2P01563 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNA2P01563 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFNA2P01563 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNA2P01563 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNA2P01563 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNA2P01563 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNA2P01563 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNA2P01563 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNA2P01563 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNA2P01563 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNA2P01563 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNA2P01563 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNA2P01563 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNA2P01563 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNA2P01563 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNA2P01563 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNA2P01563 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNA2P01563 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNA2P01563 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNA2P01563 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNA2P01563 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNA2P01563 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNA2P01563 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNA2P01563 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNA2P01563 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNA2P01563 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNA2P01563 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNA2P01563 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNA2P01563 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNA2P01563 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNA2P01563 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNA2P01563 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNA2P01563 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNA2P01563 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNA2P01563 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNA2P01563 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNA2P01563 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNA2P01563 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNA2P01563 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNA2P01563 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNA2P01563 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNA2P01563 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNA2P01563 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNA2P01563 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNA2P01563 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNA2P01563 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNA2P01563 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNA2P01563 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNA2P01563 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNA2P01563 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNA2P01563 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNA2P01563 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNA2P01563 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNA2P01563 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNA2P01563 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNA2P01563 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNA2P01563 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNA2P01563 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNA2P01563 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNA2P01563 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNA2P01563 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNA2P01563 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNA2P01563 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms