Protein–RNA interactions for Protein: O95992

CH25H, Cholesterol 25-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CH25HO95992 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CH25HO95992 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CH25HO95992 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CH25HO95992 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CH25HO95992 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CH25HO95992 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CH25HO95992 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CH25HO95992 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CH25HO95992 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CH25HO95992 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CH25HO95992 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CH25HO95992 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CH25HO95992 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CH25HO95992 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CH25HO95992 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CH25HO95992 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CH25HO95992 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CH25HO95992 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CH25HO95992 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CH25HO95992 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CH25HO95992 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CH25HO95992 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CH25HO95992 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CH25HO95992 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CH25HO95992 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CH25HO95992 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CH25HO95992 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CH25HO95992 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CH25HO95992 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CH25HO95992 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CH25HO95992 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CH25HO95992 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CH25HO95992 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CH25HO95992 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CH25HO95992 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CH25HO95992 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CH25HO95992 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CH25HO95992 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CH25HO95992 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CH25HO95992 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CH25HO95992 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CH25HO95992 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CH25HO95992 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CH25HO95992 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CH25HO95992 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CH25HO95992 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CH25HO95992 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CH25HO95992 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CH25HO95992 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CH25HO95992 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CH25HO95992 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CH25HO95992 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CH25HO95992 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CH25HO95992 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CH25HO95992 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CH25HO95992 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CH25HO95992 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CH25HO95992 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CH25HO95992 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CH25HO95992 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CH25HO95992 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CH25HO95992 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CH25HO95992 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CH25HO95992 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CH25HO95992 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CH25HO95992 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CH25HO95992 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CH25HO95992 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CH25HO95992 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CH25HO95992 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CH25HO95992 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CH25HO95992 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CH25HO95992 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CH25HO95992 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CH25HO95992 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CH25HO95992 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CH25HO95992 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CH25HO95992 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CH25HO95992 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CH25HO95992 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CH25HO95992 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CH25HO95992 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CH25HO95992 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CH25HO95992 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CH25HO95992 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CH25HO95992 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CH25HO95992 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CH25HO95992 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CH25HO95992 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CH25HO95992 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CH25HO95992 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CH25HO95992 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CH25HO95992 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CH25HO95992 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CH25HO95992 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CH25HO95992 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CH25HO95992 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CH25HO95992 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CH25HO95992 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CH25HO95992 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms