Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
BRD1O95696 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
BRD1O95696 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
BRD1O95696 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
BRD1O95696 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BRD1O95696 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
BRD1O95696 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
BRD1O95696 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
BRD1O95696 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BRD1O95696 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BRD1O95696 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BRD1O95696 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BRD1O95696 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
BRD1O95696 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
BRD1O95696 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BRD1O95696 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
BRD1O95696 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
BRD1O95696 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
BRD1O95696 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
BRD1O95696 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
BRD1O95696 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
BRD1O95696 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
BRD1O95696 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
BRD1O95696 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
BRD1O95696 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
BRD1O95696 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
BRD1O95696 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
BRD1O95696 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
BRD1O95696 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BRD1O95696 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BRD1O95696 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
BRD1O95696 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
BRD1O95696 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
BRD1O95696 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
BRD1O95696 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
BRD1O95696 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
BRD1O95696 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
BRD1O95696 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
BRD1O95696 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
BRD1O95696 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
BRD1O95696 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BRD1O95696 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BRD1O95696 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BRD1O95696 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BRD1O95696 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
BRD1O95696 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BRD1O95696 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
BRD1O95696 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BRD1O95696 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
BRD1O95696 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
BRD1O95696 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
BRD1O95696 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
BRD1O95696 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
BRD1O95696 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
BRD1O95696 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BRD1O95696 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
BRD1O95696 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRD1O95696 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BRD1O95696 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BRD1O95696 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BRD1O95696 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BRD1O95696 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRD1O95696 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRD1O95696 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BRD1O95696 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRD1O95696 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
BRD1O95696 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
BRD1O95696 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BRD1O95696 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
BRD1O95696 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
BRD1O95696 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
BRD1O95696 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BRD1O95696 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
BRD1O95696 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
BRD1O95696 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
BRD1O95696 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
BRD1O95696 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
BRD1O95696 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
BRD1O95696 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
BRD1O95696 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
BRD1O95696 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
BRD1O95696 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
BRD1O95696 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
BRD1O95696 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
BRD1O95696 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
BRD1O95696 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
BRD1O95696 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
BRD1O95696 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
BRD1O95696 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
BRD1O95696 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
BRD1O95696 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
BRD1O95696 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
BRD1O95696 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
BRD1O95696 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
BRD1O95696 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
BRD1O95696 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
BRD1O95696 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
BRD1O95696 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
BRD1O95696 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
BRD1O95696 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms