Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZIC2O95409 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZIC2O95409 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZIC2O95409 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZIC2O95409 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZIC2O95409 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZIC2O95409 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZIC2O95409 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZIC2O95409 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZIC2O95409 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZIC2O95409 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZIC2O95409 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZIC2O95409 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZIC2O95409 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZIC2O95409 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZIC2O95409 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZIC2O95409 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZIC2O95409 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZIC2O95409 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZIC2O95409 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZIC2O95409 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZIC2O95409 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZIC2O95409 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZIC2O95409 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZIC2O95409 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZIC2O95409 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZIC2O95409 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZIC2O95409 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZIC2O95409 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZIC2O95409 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZIC2O95409 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZIC2O95409 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZIC2O95409 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZIC2O95409 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZIC2O95409 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZIC2O95409 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZIC2O95409 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZIC2O95409 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZIC2O95409 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZIC2O95409 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZIC2O95409 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZIC2O95409 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZIC2O95409 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZIC2O95409 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZIC2O95409 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZIC2O95409 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZIC2O95409 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZIC2O95409 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZIC2O95409 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZIC2O95409 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZIC2O95409 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZIC2O95409 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZIC2O95409 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZIC2O95409 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZIC2O95409 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZIC2O95409 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZIC2O95409 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZIC2O95409 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZIC2O95409 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZIC2O95409 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZIC2O95409 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZIC2O95409 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZIC2O95409 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZIC2O95409 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZIC2O95409 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZIC2O95409 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZIC2O95409 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZIC2O95409 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZIC2O95409 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZIC2O95409 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZIC2O95409 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZIC2O95409 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZIC2O95409 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZIC2O95409 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZIC2O95409 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZIC2O95409 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZIC2O95409 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZIC2O95409 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ZIC2O95409 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZIC2O95409 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZIC2O95409 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZIC2O95409 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZIC2O95409 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZIC2O95409 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZIC2O95409 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZIC2O95409 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZIC2O95409 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZIC2O95409 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZIC2O95409 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZIC2O95409 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZIC2O95409 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZIC2O95409 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZIC2O95409 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZIC2O95409 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZIC2O95409 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZIC2O95409 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZIC2O95409 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZIC2O95409 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZIC2O95409 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZIC2O95409 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms