Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAPINO95295 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAPINO95295 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAPINO95295 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAPINO95295 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAPINO95295 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAPINO95295 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAPINO95295 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAPINO95295 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNAPINO95295 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAPINO95295 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAPINO95295 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAPINO95295 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPINO95295 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAPINO95295 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAPINO95295 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAPINO95295 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAPINO95295 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAPINO95295 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAPINO95295 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAPINO95295 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAPINO95295 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAPINO95295 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAPINO95295 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAPINO95295 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAPINO95295 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAPINO95295 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAPINO95295 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAPINO95295 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAPINO95295 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAPINO95295 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAPINO95295 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAPINO95295 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAPINO95295 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAPINO95295 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAPINO95295 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAPINO95295 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPINO95295 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPINO95295 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAPINO95295 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAPINO95295 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPINO95295 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPINO95295 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPINO95295 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAPINO95295 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAPINO95295 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAPINO95295 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAPINO95295 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAPINO95295 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAPINO95295 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAPINO95295 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAPINO95295 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAPINO95295 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAPINO95295 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAPINO95295 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAPINO95295 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAPINO95295 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAPINO95295 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAPINO95295 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAPINO95295 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAPINO95295 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAPINO95295 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAPINO95295 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAPINO95295 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAPINO95295 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPINO95295 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPINO95295 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPINO95295 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPINO95295 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPINO95295 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAPINO95295 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNAPINO95295 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNAPINO95295 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNAPINO95295 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAPINO95295 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAPINO95295 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAPINO95295 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAPINO95295 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAPINO95295 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAPINO95295 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAPINO95295 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAPINO95295 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAPINO95295 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAPINO95295 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAPINO95295 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAPINO95295 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAPINO95295 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAPINO95295 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAPINO95295 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAPINO95295 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAPINO95295 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAPINO95295 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAPINO95295 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAPINO95295 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAPINO95295 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAPINO95295 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAPINO95295 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAPINO95295 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAPINO95295 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAPINO95295 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms