Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTL6BO94805 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTL6BO94805 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTL6BO94805 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTL6BO94805 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTL6BO94805 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTL6BO94805 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTL6BO94805 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTL6BO94805 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTL6BO94805 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTL6BO94805 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTL6BO94805 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTL6BO94805 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTL6BO94805 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTL6BO94805 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTL6BO94805 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTL6BO94805 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTL6BO94805 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTL6BO94805 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTL6BO94805 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTL6BO94805 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTL6BO94805 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTL6BO94805 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTL6BO94805 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTL6BO94805 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTL6BO94805 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTL6BO94805 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTL6BO94805 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTL6BO94805 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTL6BO94805 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTL6BO94805 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTL6BO94805 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTL6BO94805 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTL6BO94805 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTL6BO94805 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTL6BO94805 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACTL6BO94805 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTL6BO94805 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTL6BO94805 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTL6BO94805 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTL6BO94805 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTL6BO94805 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTL6BO94805 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTL6BO94805 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTL6BO94805 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTL6BO94805 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTL6BO94805 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTL6BO94805 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTL6BO94805 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTL6BO94805 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTL6BO94805 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTL6BO94805 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTL6BO94805 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTL6BO94805 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTL6BO94805 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTL6BO94805 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTL6BO94805 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTL6BO94805 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTL6BO94805 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTL6BO94805 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTL6BO94805 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTL6BO94805 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTL6BO94805 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTL6BO94805 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTL6BO94805 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTL6BO94805 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTL6BO94805 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTL6BO94805 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTL6BO94805 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTL6BO94805 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTL6BO94805 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTL6BO94805 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTL6BO94805 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTL6BO94805 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTL6BO94805 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTL6BO94805 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTL6BO94805 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTL6BO94805 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTL6BO94805 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTL6BO94805 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTL6BO94805 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTL6BO94805 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTL6BO94805 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTL6BO94805 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTL6BO94805 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTL6BO94805 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTL6BO94805 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTL6BO94805 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTL6BO94805 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTL6BO94805 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTL6BO94805 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTL6BO94805 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTL6BO94805 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTL6BO94805 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTL6BO94805 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTL6BO94805 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTL6BO94805 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTL6BO94805 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTL6BO94805 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTL6BO94805 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms