Protein–RNA interactions for Protein: O76011

KRT34, Keratin, type I cuticular Ha4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT34O76011 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT34O76011 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT34O76011 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT34O76011 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT34O76011 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT34O76011 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT34O76011 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT34O76011 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT34O76011 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT34O76011 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT34O76011 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT34O76011 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT34O76011 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT34O76011 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT34O76011 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT34O76011 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT34O76011 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT34O76011 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT34O76011 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT34O76011 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT34O76011 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT34O76011 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT34O76011 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT34O76011 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT34O76011 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT34O76011 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT34O76011 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT34O76011 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT34O76011 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT34O76011 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT34O76011 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT34O76011 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT34O76011 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT34O76011 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT34O76011 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT34O76011 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT34O76011 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT34O76011 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT34O76011 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT34O76011 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT34O76011 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT34O76011 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT34O76011 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT34O76011 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT34O76011 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT34O76011 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT34O76011 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT34O76011 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT34O76011 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT34O76011 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT34O76011 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT34O76011 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT34O76011 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT34O76011 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT34O76011 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT34O76011 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT34O76011 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT34O76011 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT34O76011 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT34O76011 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT34O76011 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT34O76011 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT34O76011 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT34O76011 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT34O76011 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT34O76011 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT34O76011 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT34O76011 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT34O76011 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT34O76011 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT34O76011 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT34O76011 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT34O76011 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT34O76011 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT34O76011 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT34O76011 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT34O76011 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT34O76011 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT34O76011 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT34O76011 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT34O76011 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT34O76011 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT34O76011 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT34O76011 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT34O76011 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT34O76011 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT34O76011 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT34O76011 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT34O76011 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT34O76011 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT34O76011 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT34O76011 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT34O76011 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT34O76011 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT34O76011 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT34O76011 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT34O76011 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT34O76011 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT34O76011 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT34O76011 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms