Protein–RNA interactions for Protein: O75841

UPK1B, Uroplakin-1b, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1BO75841 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK1BO75841 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK1BO75841 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPK1BO75841 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPK1BO75841 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPK1BO75841 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPK1BO75841 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPK1BO75841 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPK1BO75841 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPK1BO75841 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPK1BO75841 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPK1BO75841 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPK1BO75841 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPK1BO75841 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPK1BO75841 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPK1BO75841 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPK1BO75841 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPK1BO75841 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPK1BO75841 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK1BO75841 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK1BO75841 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPK1BO75841 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPK1BO75841 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPK1BO75841 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UPK1BO75841 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPK1BO75841 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPK1BO75841 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPK1BO75841 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPK1BO75841 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK1BO75841 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK1BO75841 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPK1BO75841 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPK1BO75841 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPK1BO75841 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPK1BO75841 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPK1BO75841 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPK1BO75841 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPK1BO75841 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPK1BO75841 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPK1BO75841 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPK1BO75841 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPK1BO75841 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPK1BO75841 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPK1BO75841 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPK1BO75841 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPK1BO75841 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPK1BO75841 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPK1BO75841 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPK1BO75841 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPK1BO75841 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPK1BO75841 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPK1BO75841 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPK1BO75841 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPK1BO75841 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPK1BO75841 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPK1BO75841 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPK1BO75841 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPK1BO75841 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPK1BO75841 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPK1BO75841 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPK1BO75841 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPK1BO75841 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPK1BO75841 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPK1BO75841 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPK1BO75841 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPK1BO75841 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPK1BO75841 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPK1BO75841 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPK1BO75841 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPK1BO75841 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPK1BO75841 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPK1BO75841 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPK1BO75841 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPK1BO75841 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPK1BO75841 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPK1BO75841 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPK1BO75841 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPK1BO75841 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPK1BO75841 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPK1BO75841 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPK1BO75841 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UPK1BO75841 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPK1BO75841 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPK1BO75841 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPK1BO75841 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPK1BO75841 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPK1BO75841 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPK1BO75841 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPK1BO75841 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPK1BO75841 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UPK1BO75841 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPK1BO75841 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPK1BO75841 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPK1BO75841 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPK1BO75841 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UPK1BO75841 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPK1BO75841 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPK1BO75841 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPK1BO75841 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPK1BO75841 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms